45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7563 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  37.39 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  39.3 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  37.83 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  36.29 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  36.6 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  36.55 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  35.06 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  36.89 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  34.57 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  32.05 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  34.38 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  34.89 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  31.23 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  28.7 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  29.71 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  28.7 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  27.97 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  31.47 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  30.21 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  27.23 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  26.25 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  29.46 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  30.04 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  29.06 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  24 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  26.64 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  27.27 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  26.47 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  26.03 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  26.03 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  23.36 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  25.21 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  27.94 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  26.99 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  26.5 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  25.55 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  26.56 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  24.57 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  27.11 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  27.5 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  26.6 
 
 		 315 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  22.98 
 
 		 264 aa  42  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>