194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7541 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7541  transposase  100 
 
 		 119 aa  244  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  87.37 
 
 		 238 aa  177  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  87.37 
 
 		 238 aa  175  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  84.21 
 
 		 238 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  84.21 
 
 		 238 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  82.11 
 
 		 243 aa  168  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  82.11 
 
 		 238 aa  167  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  83.16 
 
 		 238 aa  167  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8072  transposase  82.98 
 
 		 94 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  77.17 
 
 		 180 aa  157  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  67.44 
 
 		 232 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  65.12 
 
 		 237 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  61.8 
 
 		 237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  55.68 
 
 		 236 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  57.83 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  57.83 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  57.83 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  52.81 
 
 		 237 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  52.81 
 
 		 237 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  52.81 
 
 		 237 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  52.81 
 
 		 237 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  52.81 
 
 		 237 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  52.81 
 
 		 237 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  52.81 
 
 		 237 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  51.76 
 
 		 233 aa  93.2  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  48.89 
 
 		 233 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  48.89 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  48.89 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  48.89 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  48.91 
 
 		 251 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  45.98 
 
 		 233 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  44.33 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  47.56 
 
 		 238 aa  80.9  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  47.56 
 
 		 238 aa  80.9  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  47.56 
 
 		 238 aa  80.9  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  47.62 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  47.62 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  47.62 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  47.62 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  47.62 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  47.62 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  43.18 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  49.38 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5571  putative transposase  45.35 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  44.05 
 
 		 233 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  46.91 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  44.05 
 
 		 233 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  44.05 
 
 		 233 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  44.05 
 
 		 233 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  44.05 
 
 		 233 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4777  putative transposase  65.22 
 
 		 52 aa  69.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7514  transposase  53.12 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  40.7 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  38.55 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  37.04 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  35.37 
 
 		 238 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1456  hypothetical protein  53.45 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  39.24 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2646  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0437293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  41.46 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  42.5 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2299  hypothetical protein  41.43 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  38.37 
 
 		 340 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  33.72 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  33.72 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  33.72 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  42.5 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  33.33 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  32.56 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  33.64 
 
 		 211 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  36.47 
 
 		 253 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  36.47 
 
 		 340 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  65.62 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  36.47 
 
 		 340 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  36.47 
 
 		 340 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  36.47 
 
 		 340 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  36.47 
 
 		 340 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  36.47 
 
 		 340 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  36.47 
 
 		 340 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  37.97 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  33.64 
 
 		 237 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  35.37 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  40 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  34.83 
 
 		 343 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0568  transposase  32.5 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.084687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  35.9 
 
 		 226 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  37.88 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  37.65 
 
 		 353 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  37.65 
 
 		 353 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  37.65 
 
 		 353 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  37.18 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  37.65 
 
 		 353 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  34.52 
 
 		 263 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  33.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  31.4 
 
 		 226 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  31.4 
 
 		 226 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  26.14 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  32.93 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  31.4 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>