277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7539 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 419 aa  845    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  49.75 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  47.68 
 
 		 426 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  47.43 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  46.78 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  47.38 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  43.31 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  42.69 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  42.69 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  40.67 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  39.9 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.52 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.65 
 
 		 410 aa  250  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.75 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.47 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 		 429 aa  237  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  36.6 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  38.61 
 
 		 429 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  38.22 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.44 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  35.08 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.51 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  36.75 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  35.65 
 
 		 411 aa  223  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 		 427 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.14 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.95 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 		 412 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  37 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  36.59 
 
 		 416 aa  216  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  35.16 
 
 		 425 aa  216  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.93 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  34.74 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 		 417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.23 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  37.17 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  35.4 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  35.8 
 
 		 418 aa  206  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  37.28 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  35.48 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.27 
 
 		 447 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.71 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  36.28 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.77 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.21 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  34.08 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  34.9 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  33.83 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  35.11 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.95 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.95 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  35.28 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.96 
 
 		 518 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 		 408 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 		 589 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  33.99 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  32.78 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  36.22 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  34.29 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  35.17 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.6 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  36.27 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  37.43 
 
 		 414 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  34.49 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.16 
 
 		 589 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.1 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  35.53 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  35.96 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.77 
 
 		 428 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  37.43 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.43 
 
 		 523 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.75 
 
 		 422 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.1 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 		 421 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  34.91 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  37.17 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  34.06 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.21 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.01 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  35.97 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  33.6 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  36.97 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.33 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>