257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7524 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7524  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 394 aa  815    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4005  aromatic amino acid aminotransferase  63.01 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143022  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2545  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0121  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0886  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2635  aromatic amino acid aminotransferase  49.23 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.574688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0630  aromatic amino acid aminotransferase  48.98 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0789  aromatic amino acid aminotransferase  45.15 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  45.32 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  44.5 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1232  aromatic amino acid aminotransferase  47.47 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  45.57 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  45.57 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1733  aromatic amino acid aminotransferase  45.57 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162633  hitchhiker  0.000702513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  44.81 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  44.56 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  45.32 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  45.32 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  44.56 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  44.56 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  44.05 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  43.5 
 
 		 401 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0447  aromatic amino acid aminotransferase  43.77 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05719  aromatic amino acid aminotransferase  42.39 
 
 		 398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  44.05 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000111  aspartate aminotransferase  41.88 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  43.29 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01010  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  354  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00165068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  43.54 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0028  aromatic amino acid aminotransferase  44.64 
 
 		 399 aa  349  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  40.51 
 
 		 396 aa  342  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0763  aromatic amino acid aminotransferase  46.15 
 
 		 401 aa  342  5.999999999999999e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615005  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3509  aromatic amino acid aminotransferase  45.77 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  41.52 
 
 		 396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  42.28 
 
 		 397 aa  336  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 397 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  40.81 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4192  aromatic amino acid aminotransferase  44.19 
 
 		 396 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516062  normal  0.0204387 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  41.77 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  41.77 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  41.77 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  41.6 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4646  aromatic amino acid aminotransferase  42.64 
 
 		 399 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53010  aromatic amino acid aminotransferase  42.89 
 
 		 399 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  41.52 
 
 		 401 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  40 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  40.76 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  40.79 
 
 		 397 aa  322  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 396 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  39.33 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3114  aromatic amino acid aminotransferase  42.27 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.384285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5386  aromatic amino acid aminotransferase  42.82 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.409565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  40 
 
 		 396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3552  aromatic amino acid aminotransferase  41.31 
 
 		 398 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.0997527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  40.51 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  40.51 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  40.51 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  39.64 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1497  aromatic amino acid aminotransferase  39.9 
 
 		 397 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  38.48 
 
 		 399 aa  312  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  40 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4224  aromatic amino acid aminotransferase  43.39 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  40 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3390  aromatic amino acid aminotransferase  38.07 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  39.64 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0792  aromatic amino acid aminotransferase  41.73 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  38.48 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 396 aa  309  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  38.86 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  40.41 
 
 		 401 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  40.46 
 
 		 401 aa  298  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4445  aromatic amino acid aminotransferase  38.5 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.451024 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0225  aromatic amino acid aminotransferase  38.54 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0145  aromatic amino acid aminotransferase  42.34 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  39.55 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0407  aromatic amino acid aminotransferase  35.44 
 
 		 396 aa  293  5e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.761548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>