112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7505 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  241  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55.26 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.14 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55.65 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  53.51 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55.65 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  50.43 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  48.25 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  46.49 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  48.54 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.63 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.63 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  46 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  48.54 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  46.46 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  42.24 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  42.24 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  35.59 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  35.42 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  39.05 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.24 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.24 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  39.13 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.19 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.36 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.36 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  34.38 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.29 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  36.26 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.26 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.36 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.51 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  33.91 
 
 		 120 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.26 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.26 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  33.63 
 
 		 119 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.13 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.63 
 
 		 119 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  36.19 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  36.26 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  32.43 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  31.53 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  32.67 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  35.16 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  33.93 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.16 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.16 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.3 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.43 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  30.43 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.18 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.1 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.25 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.9 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.52 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.21 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.21 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.29 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.62 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  28.43 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.96 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  40.23 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.35 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  40.23 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  40.26 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.12 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  32.35 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.35 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.35 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  34.86 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.26 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.92 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.84 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.47 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.42 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.09 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.16 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.29 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.26 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.57 
 
 		 252 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  39.29 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  32.35 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.5 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  32.61 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.67 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.48 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.31 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3377  putative cytoplasmic protein  36.25 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.627866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3370  hypothetical protein  36.25 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.587978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3303  putative cytoplasmic protein  36.25 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3298  putative cytoplasmic protein  36.25 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.571522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3472  hypothetical protein  36.25 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.96 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0766  hypothetical protein  36.11 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.877225  normal  0.182245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>