More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7434 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  100 
 
 		 287 aa  550  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  82.23 
 
 		 287 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6136  inner-membrane translocator  50 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4798  inner-membrane translocator  49.46 
 
 		 304 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337539  normal  0.0254161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4887  inner-membrane translocator  48.74 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5242  ABC transporter permease  41.34 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.157706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.45 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.41 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7090  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  38.82 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 652 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0907  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.794087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4442  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.69 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2302  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.418685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1543  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  31.2 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  30.69 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0780  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  26.99 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1139  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 542 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.42 
 
 		 523 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 537 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.25 
 
 		 520 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 551 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 639 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  26.71 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.02 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 548 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>