88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7422 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  32.7 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  27.75 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.59 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  30.99 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  28.74 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  29.11 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  39.84 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  28.49 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  35.38 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  28.99 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  27.33 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  27.33 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  31.36 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.33 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  31.08 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.32 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  31.08 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  31.08 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  31.11 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  30.19 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  27.84 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  28.46 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  23.97 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  31.01 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.12 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25.32 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.45 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.08 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  26.44 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  29.67 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  26.53 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  29.48 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  27.05 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  28.47 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  26.53 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  25.5 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  27.33 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  34.86 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  26.59 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  26.28 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.35 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  25.14 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.14 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  25.97 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.02 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  28.28 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.92 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  45.45 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  45.45 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  32.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  45.45 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  45.45 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  45.45 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  45.45 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.97 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  33.6 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  30.71 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 		 184 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 		 184 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.93 
 
 		 181 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  26.4 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  26.15 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 214 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  31.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>