100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7407 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  100 
 
 		 775 aa  1587    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 839 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 839 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 841 aa  254  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 824 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  29.55 
 
 		 797 aa  247  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 805 aa  236  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 826 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 802 aa  208  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 825 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 775 aa  204  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 821 aa  204  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 807 aa  203  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 856 aa  203  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 825 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 825 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  25.37 
 
 		 741 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 868 aa  195  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 772 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 821 aa  191  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 848 aa  185  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 777 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 822 aa  184  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 777 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 777 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 788 aa  173  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 769 aa  158  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 760 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 801 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 778 aa  153  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 781 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 741 aa  142  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  24.48 
 
 		 787 aa  132  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 873 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 873 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 779 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 773 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 770 aa  121  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  22.78 
 
 		 935 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 813 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 1188 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 733 aa  71.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 711 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  31.49 
 
 		 683 aa  65.1  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 709 aa  65.1  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 698 aa  62  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 683 aa  61.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 787 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 739 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 785 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 696 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 696 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 786 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  21.08 
 
 		 700 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 706 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 836 aa  53.5  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 684 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 715 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  24.58 
 
 		 715 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 815 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23 
 
 		 710 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 764 aa  51.2  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 		 699 aa  51.6  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  31.4 
 
 		 683 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 720 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 730 aa  50.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 766 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 692 aa  50.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 773 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 		 716 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 634 aa  48.9  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 736 aa  48.5  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 710 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 694 aa  47  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 851 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 678 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 667 aa  47.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 853 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 705 aa  46.6  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 723 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  27.54 
 
 		 668 aa  47  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  22.46 
 
 		 701 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 688 aa  46.2  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  29.05 
 
 		 693 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  28.02 
 
 		 705 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 683 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 710 aa  45.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  21.1 
 
 		 700 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 708 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  24.74 
 
 		 691 aa  45.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  24.3 
 
 		 670 aa  44.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 681 aa  45.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  32.94 
 
 		 623 aa  44.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 815 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 769 aa  44.3  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  25.83 
 
 		 699 aa  44.3  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>