More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7293 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 835 aa  1713    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 712 aa  312  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 719 aa  213  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 686 aa  207  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 694 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 705 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 705 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 705 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  26.95 
 
 		 694 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 692 aa  180  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 711 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 694 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 694 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 707 aa  172  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 685 aa  171  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 685 aa  171  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 711 aa  165  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 685 aa  164  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  25.22 
 
 		 685 aa  160  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 685 aa  160  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 685 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 755 aa  157  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  26.07 
 
 		 687 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 686 aa  155  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 685 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 749 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 720 aa  148  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 713 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 758 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.11 
 
 		 715 aa  146  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 737 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 695 aa  139  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 753 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 730 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 712 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 690 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 687 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 695 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 686 aa  134  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 728 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 690 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 775 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 736 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 753 aa  131  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 761 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 794 aa  129  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 853 aa  128  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 755 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 775 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 851 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 766 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 759 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 736 aa  125  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 761 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 758 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 786 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 758 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  25.66 
 
 		 714 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 747 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 780 aa  120  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 803 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 751 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  34.1 
 
 		 815 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 704 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 761 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 731 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 729 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 814 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 730 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 792 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 758 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 713 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 720 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 680 aa  115  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 835 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 745 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  24.96 
 
 		 691 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 710 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 730 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 763 aa  115  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 729 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 710 aa  114  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 780 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 829 aa  114  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 790 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 758 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 764 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 790 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 803 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 808 aa  111  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.72 
 
 		 685 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 855 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 750 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 694 aa  110  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.65 
 
 		 739 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 732 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 767 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 774 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 713 aa  108  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>