135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7274 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  100 
 
 		 990 aa  1919    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  34.78 
 
 		 995 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  34.06 
 
 		 986 aa  298  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.65 
 
 		 1011 aa  278  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.02 
 
 		 1029 aa  278  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  31.74 
 
 		 1550 aa  278  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  33.95 
 
 		 2365 aa  277  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  33.95 
 
 		 2346 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  34.82 
 
 		 2371 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  31.89 
 
 		 1119 aa  272  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  34.62 
 
 		 2366 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  32.69 
 
 		 1508 aa  269  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32 
 
 		 1848 aa  269  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  33.4 
 
 		 1033 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  35.74 
 
 		 4238 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  35.74 
 
 		 4238 aa  265  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  35.74 
 
 		 3822 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  34.4 
 
 		 983 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  32.82 
 
 		 985 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.15 
 
 		 1285 aa  261  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  33.28 
 
 		 2396 aa  257  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  34.46 
 
 		 3954 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  33.91 
 
 		 1055 aa  254  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  34.98 
 
 		 1004 aa  254  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  32.58 
 
 		 994 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  34.49 
 
 		 995 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  34.36 
 
 		 991 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.09 
 
 		 919 aa  244  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  30.6 
 
 		 2003 aa  243  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.14 
 
 		 1227 aa  242  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.2 
 
 		 972 aa  241  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  33.15 
 
 		 1001 aa  240  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  32.65 
 
 		 1001 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  32.47 
 
 		 650 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  31.89 
 
 		 3506 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  32.95 
 
 		 1038 aa  230  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  31.35 
 
 		 1028 aa  230  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  30.36 
 
 		 1782 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  32.77 
 
 		 1053 aa  228  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  34.21 
 
 		 1062 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1164 aa  212  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  32.38 
 
 		 1130 aa  209  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  31.01 
 
 		 1129 aa  205  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  31.01 
 
 		 1131 aa  205  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  30.85 
 
 		 1129 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  30.85 
 
 		 1131 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  30.85 
 
 		 1131 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  30.85 
 
 		 1131 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  29.62 
 
 		 2711 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  30.18 
 
 		 677 aa  198  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  28.95 
 
 		 1333 aa  197  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  27.81 
 
 		 1519 aa  197  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1881 aa  196  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  30.7 
 
 		 1131 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  33.42 
 
 		 1056 aa  187  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.99 
 
 		 1125 aa  162  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  30.3 
 
 		 816 aa  160  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  28.19 
 
 		 1006 aa  159  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  31.73 
 
 		 1011 aa  157  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 		 1769 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.27 
 
 		 1489 aa  153  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  27.58 
 
 		 1152 aa  153  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.96 
 
 		 3629 aa  151  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  26.07 
 
 		 980 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  28.25 
 
 		 1016 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  26.99 
 
 		 407 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  26.91 
 
 		 1458 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1446 aa  107  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  26.08 
 
 		 1459 aa  107  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  26.12 
 
 		 2407 aa  96.3  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  26.76 
 
 		 488 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1325 aa  88.6  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.89 
 
 		 1322 aa  87.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.42 
 
 		 1081 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25.66 
 
 		 1066 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.22 
 
 		 1532 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.41 
 
 		 774 aa  80.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  25.92 
 
 		 814 aa  78.2  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.97 
 
 		 1179 aa  77  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.4 
 
 		 882 aa  74.7  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  34.42 
 
 		 987 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.82 
 
 		 1256 aa  68.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  25.98 
 
 		 942 aa  68.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  24.61 
 
 		 1180 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 2848 aa  65.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  25.91 
 
 		 1677 aa  65.9  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  22.5 
 
 		 311 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.47 
 
 		 1134 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  23.67 
 
 		 1012 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.61 
 
 		 906 aa  59.3  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  44.05 
 
 		 1111 aa  58.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  24.63 
 
 		 909 aa  56.6  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  23.33 
 
 		 1154 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  23.91 
 
 		 1156 aa  56.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  24.64 
 
 		 959 aa  55.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  22.15 
 
 		 1025 aa  55.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  21.54 
 
 		 1369 aa  55.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.28 
 
 		 913 aa  54.7  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  24.62 
 
 		 939 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  23.48 
 
 		 998 aa  54.3  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>