More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7242 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
531 aa  1086    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3783  gamma-glutamyltransferase  57.7 
 
 
533 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903346  normal  0.268995 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  58.11 
 
 
529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  51.67 
 
 
533 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  54.43 
 
 
525 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  52.35 
 
 
534 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  51.69 
 
 
529 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  52.35 
 
 
528 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  51.88 
 
 
528 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  52.35 
 
 
528 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  51.5 
 
 
528 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  52.04 
 
 
511 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  52.53 
 
 
528 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  51.98 
 
 
525 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  52.92 
 
 
525 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  48.5 
 
 
525 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  49.25 
 
 
527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  49.35 
 
 
525 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  47.08 
 
 
522 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  48.79 
 
 
542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2749  gamma-glutamyltransferase  50.55 
 
 
536 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724235  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  45.68 
 
 
525 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  45.88 
 
 
527 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  42.01 
 
 
590 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  40 
 
 
528 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  44.3 
 
 
543 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  43.07 
 
 
573 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  46.12 
 
 
542 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  40.64 
 
 
563 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  46.21 
 
 
542 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  40.93 
 
 
545 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  40.93 
 
 
570 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  40.37 
 
 
565 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  40.75 
 
 
570 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  40.75 
 
 
570 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  40.3 
 
 
564 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 
568 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  41.83 
 
 
545 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 
570 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  40.22 
 
 
563 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  40.29 
 
 
541 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 
570 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  39.07 
 
 
570 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  39.07 
 
 
570 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  39.07 
 
 
570 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  41.12 
 
 
512 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  41.1 
 
 
545 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  39.05 
 
 
561 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  41.14 
 
 
542 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  40.07 
 
 
579 aa  353  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  41.14 
 
 
542 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  41.73 
 
 
634 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  40.39 
 
 
568 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  41.83 
 
 
557 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  41.83 
 
 
557 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  41.83 
 
 
557 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  40.49 
 
 
534 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  39.67 
 
 
593 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  39.88 
 
 
529 aa  347  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  40.68 
 
 
536 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  38.62 
 
 
526 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  41.67 
 
 
536 aa  345  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 
557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 
557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 
557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 
557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  38.48 
 
 
541 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  41.94 
 
 
546 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 
534 aa  342  9e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  39.51 
 
 
533 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  40.85 
 
 
533 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  42.05 
 
 
546 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  41.56 
 
 
538 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  38.79 
 
 
529 aa  336  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  38.5 
 
 
534 aa  334  3e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  39.52 
 
 
545 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  40.15 
 
 
531 aa  331  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  40.92 
 
 
546 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  40.92 
 
 
546 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  37.73 
 
 
553 aa  329  9e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  38.84 
 
 
530 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  41.08 
 
 
539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  38.94 
 
 
537 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  40.73 
 
 
546 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  40.11 
 
 
542 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  40.55 
 
 
546 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  40.59 
 
 
552 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  38.53 
 
 
558 aa  325  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  39.78 
 
 
540 aa  322  8e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  39.81 
 
 
531 aa  322  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  40.04 
 
 
562 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  39.52 
 
 
535 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  39.58 
 
 
538 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  40.37 
 
 
546 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  37.7 
 
 
601 aa  319  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  37.73 
 
 
539 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  35.23 
 
 
589 aa  316  6e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  38.42 
 
 
538 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 
537 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 
542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>