More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7191 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 
564 aa  1122    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  54.66 
 
 
575 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
571 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 
571 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  48.66 
 
 
571 aa  534  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  49.29 
 
 
572 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  47.41 
 
 
566 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 
539 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  48.33 
 
 
546 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  47.58 
 
 
549 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  44.22 
 
 
530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  44.22 
 
 
530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  46.03 
 
 
593 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  50.27 
 
 
592 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  47.94 
 
 
539 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  47.75 
 
 
539 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  50 
 
 
592 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  46 
 
 
606 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  44.73 
 
 
593 aa  465  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  47.75 
 
 
539 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  50.19 
 
 
592 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.36 
 
 
568 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  44.15 
 
 
610 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  44.33 
 
 
601 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
544 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
601 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  46.76 
 
 
566 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  43.72 
 
 
547 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.86 
 
 
599 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.77 
 
 
534 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
540 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  45.59 
 
 
561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.74 
 
 
623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  46.18 
 
 
568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.8 
 
 
596 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  45.06 
 
 
583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  46 
 
 
558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  45.25 
 
 
545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  46.32 
 
 
615 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  46.55 
 
 
534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.6 
 
 
545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  45.27 
 
 
588 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  45.17 
 
 
611 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  44.85 
 
 
563 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 
539 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  47.01 
 
 
548 aa  452  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.62 
 
 
531 aa  448  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  45.29 
 
 
564 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  45.42 
 
 
545 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  44.74 
 
 
588 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  45.52 
 
 
566 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  46.36 
 
 
576 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.42 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  40.4 
 
 
603 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  44.27 
 
 
573 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  40.67 
 
 
629 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  44.59 
 
 
534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  45.49 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  47.28 
 
 
538 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  45.15 
 
 
549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  46.47 
 
 
551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  41.16 
 
 
578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  43.35 
 
 
623 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  45.04 
 
 
599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  44.78 
 
 
594 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.03 
 
 
609 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  46.93 
 
 
585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  43.69 
 
 
543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  44.9 
 
 
611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  42.02 
 
 
617 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  45.74 
 
 
571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 
530 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.32 
 
 
643 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  43.3 
 
 
612 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  40.23 
 
 
602 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  43.75 
 
 
623 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.81 
 
 
586 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  46.93 
 
 
537 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  43.4 
 
 
624 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  43.89 
 
 
640 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 
536 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.33 
 
 
611 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  43.55 
 
 
561 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 
543 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  43.84 
 
 
565 aa  442  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  44.62 
 
 
571 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  45.58 
 
 
609 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  45.81 
 
 
562 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  45.27 
 
 
557 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
536 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  45.34 
 
 
536 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.28 
 
 
583 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  44.87 
 
 
546 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  45.44 
 
 
536 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  46.68 
 
 
544 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  47.39 
 
 
540 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  46.52 
 
 
544 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  45.64 
 
 
557 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  44.17 
 
 
624 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  42.86 
 
 
597 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>