More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7188 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  100 
 
 		 349 aa  709    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  84.23 
 
 		 353 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  67.25 
 
 		 359 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  68.86 
 
 		 334 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  67.87 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  62.99 
 
 		 337 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  67.57 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  65.56 
 
 		 339 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  66.67 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  60.78 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  59.82 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  61.79 
 
 		 335 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  63.25 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  61.98 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  61.75 
 
 		 335 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  60.3 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  58.86 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  58.56 
 
 		 336 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  59.46 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  62.84 
 
 		 342 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  57.06 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  57.4 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  56.8 
 
 		 333 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  55.29 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  55.29 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  55.12 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  55.12 
 
 		 332 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  40.79 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  41.84 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  40.54 
 
 		 343 aa  229  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  42.59 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  43.87 
 
 		 317 aa  225  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  41.1 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.12 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.28 
 
 		 325 aa  222  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  39.67 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  36.61 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  37.8 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  40.66 
 
 		 326 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  39.32 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  39.34 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  39.67 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  40.45 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  37.97 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  40.51 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  43.09 
 
 		 353 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  36.53 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  38.78 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  39.94 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  37.27 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  38.41 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  38.24 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  41.12 
 
 		 352 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  36.34 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  38.76 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  39.27 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  39.01 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.38 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.23 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  39.38 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.88 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  35.71 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  40.58 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  38.24 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  38.85 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  36.28 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  38.02 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  38.51 
 
 		 349 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  42.76 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  36.65 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  39.62 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  40.45 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  38.77 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  39.25 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.45 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  39.56 
 
 		 336 aa  199  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  38.56 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  40 
 
 		 339 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  40.95 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  36.42 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  37.14 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  37.94 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  39.81 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  38.3 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  37.26 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1473  aldo/keto reductase  41.91 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0111458  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>