More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7166 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  100 
 
 		 261 aa  507  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.38 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  56.76 
 
 		 279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  54.55 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  54.55 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  54.55 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.55 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.61 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  52.31 
 
 		 285 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.81 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.59 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  50.98 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.45 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  53.78 
 
 		 275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  53.78 
 
 		 275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  53.78 
 
 		 275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  53.6 
 
 		 275 aa  244  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  53.6 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.6 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  53.2 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  53.2 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  53.6 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.18 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  48.84 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  50.9 
 
 		 283 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  50.9 
 
 		 253 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  50.9 
 
 		 283 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.06 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  55.07 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  50.88 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.2 
 
 		 275 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.25 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.59 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  50.61 
 
 		 330 aa  225  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  50.88 
 
 		 272 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.98 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  49.22 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.63 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  48.63 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.4 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.21 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  48.24 
 
 		 320 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.31 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.66 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.98 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.09 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.66 
 
 		 321 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.66 
 
 		 269 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.66 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 		 412 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.32 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 		 286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  37.82 
 
 		 288 aa  148  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  33.48 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  33.48 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.91 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 		 286 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 		 286 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0961261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.47 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2313  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797662  hitchhiker  0.00000011817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.71 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  35.47 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2930  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>