252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7148 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7148  transposase  100 
 
 
232 aa  480  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  81.73 
 
 
237 aa  319  2e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  72.59 
 
 
243 aa  297  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  70.56 
 
 
238 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  66.2 
 
 
238 aa  284  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  67.8 
 
 
238 aa  283  1e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  71.57 
 
 
238 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  76.16 
 
 
180 aa  273  2e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  71.07 
 
 
238 aa  273  2e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  70.05 
 
 
238 aa  269  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  62.37 
 
 
237 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  56.19 
 
 
233 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  55.71 
 
 
233 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  55.71 
 
 
233 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  55.71 
 
 
233 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  55.71 
 
 
233 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  52.91 
 
 
233 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  54.04 
 
 
236 aa  211  6e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  55.05 
 
 
236 aa  199  2e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  67.13 
 
 
196 aa  199  4e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  54.55 
 
 
236 aa  197  1e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  54.55 
 
 
236 aa  197  1e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  51.56 
 
 
233 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  49.5 
 
 
231 aa  181  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  50.26 
 
 
233 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  50.26 
 
 
233 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  50.26 
 
 
233 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  50.26 
 
 
233 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  50.26 
 
 
233 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  49.22 
 
 
238 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  49.22 
 
 
238 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  49.22 
 
 
238 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  48.5 
 
 
232 aa  169  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  48.7 
 
 
238 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  47.5 
 
 
242 aa  164  1e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  47.5 
 
 
242 aa  164  1e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  47.5 
 
 
242 aa  164  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  47.5 
 
 
242 aa  164  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  47.5 
 
 
242 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  47.5 
 
 
242 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  44.86 
 
 
237 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  47.94 
 
 
231 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  44.86 
 
 
237 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  44.86 
 
 
237 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  44.86 
 
 
237 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  44.86 
 
 
237 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  44.86 
 
 
237 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  44.86 
 
 
237 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  45.31 
 
 
233 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  43.81 
 
 
251 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7541  transposase  67.44 
 
 
119 aa  120  1e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  51.54 
 
 
162 aa  120  2e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  33.87 
 
 
226 aa  119  4e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  33.87 
 
 
226 aa  119  4e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  33.87 
 
 
226 aa  119  4e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  33.51 
 
 
226 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  34.27 
 
 
226 aa  115  4e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  32.99 
 
 
226 aa  115  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8072  transposase  63.53 
 
 
94 aa  115  7e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  33.33 
 
 
236 aa  115  8e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  32.99 
 
 
226 aa  114  1e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  32.47 
 
 
226 aa  114  2e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  32.47 
 
 
226 aa  114  2e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  6.56405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  32.47 
 
 
226 aa  112  4e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  32.99 
 
 
226 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  32.82 
 
 
226 aa  111  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  32.47 
 
 
226 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  32.47 
 
 
226 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 
238 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5571  putative transposase  55.32 
 
 
105 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1460  transposase  51.79 
 
 
166 aa  99.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  34.25 
 
 
238 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  33.87 
 
 
222 aa  98.6  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  33.51 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  30.32 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  34.65 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  33.16 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  33.66 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  34.83 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  37.85 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  32.11 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  32.11 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  31.55 
 
 
302 aa  94.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  31.55 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  31.05 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  33 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  31.91 
 
 
235 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  32.43 
 
 
235 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  34.92 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  34.92 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  34.92 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  34.92 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  34.94 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7263  transposase  78.95 
 
 
104 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  34.21 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  33.57 
 
 
164 aa  93.2  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  34.92 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  31.46 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  34.92 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  34.92 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>