More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7122 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  100 
 
 		 426 aa  838    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  39.69 
 
 		 413 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 418 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  34.5 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 412 aa  243  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 420 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  40.27 
 
 		 418 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 476 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  36.12 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  35.57 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 474 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 456 aa  236  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 457 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  39.22 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 424 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 419 aa  226  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.11 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  33.56 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 419 aa  223  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 432 aa  222  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 450 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  36.32 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 431 aa  216  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 403 aa  212  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  35.42 
 
 		 441 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 425 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 494 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  34.66 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 426 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 413 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  33.74 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  36.39 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 491 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 416 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.02 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 440 aa  189  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 406 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 475 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 417 aa  186  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  30.49 
 
 		 410 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  32.84 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 412 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>