More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7081 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  40.6 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  38.59 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0081  hypothetical protein  39.8 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  34.64 
 
 		 333 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.87 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  34.49 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  31.35 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37.33 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  35.79 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  31.45 
 
 		 315 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.36 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  35.74 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.16 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.73 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  35.84 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  36.15 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  34.95 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  30.82 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  34.97 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  35.84 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  36.39 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  31.93 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  34.19 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.7 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  35.77 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  35.07 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  33.92 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  32.17 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.4 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  34.87 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  33.76 
 
 		 320 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  34.74 
 
 		 330 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.62 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  30.26 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  34.67 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.14 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  32.8 
 
 		 318 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  36.11 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  33.21 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  34.24 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  32.59 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  30.87 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  32.74 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  32.8 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  31.07 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  33.21 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  33.11 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  32.8 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  33.46 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  34.58 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  32.76 
 
 		 324 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  35.59 
 
 		 332 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.53 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  35.56 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  31.82 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  33.86 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  33.54 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  32.63 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  35.77 
 
 		 322 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  31.08 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.98 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  30.89 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  34.97 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.29 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.29 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.42 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  32.42 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  32.38 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  32.63 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  34.74 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  32.87 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  34.97 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1019  hypothetical protein  32.17 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  34.33 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  34.94 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  32.62 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  32.38 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  32.88 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  33.45 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  31.91 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.9 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  31.91 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  35.56 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  35.42 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  35.16 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  32.87 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  30.99 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  35.14 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  32.5 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  33.77 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  34.56 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  32.62 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  34.07 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  32.65 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  31.53 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  31.8 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>