39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7057 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  229  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  59.05 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  68.24 
 
 		 85 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  66.27 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  62.2 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  52.75 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  49.41 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  49.41 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  50.7 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  46.58 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  37.86 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  47.14 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  47.14 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  47.3 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  38.32 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  51.85 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  51.85 
 
 		 81 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  51.85 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  44.29 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  52.54 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  40 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  31.48 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  38.03 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  38.03 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  44.29 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  33.68 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  44.29 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  39.44 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  37.84 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  36.71 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  32 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  33.8 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  42.86 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  41.79 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  36 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  39.13 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  51.16 
 
 		 1822 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  32.86 
 
 		 79 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>