31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7054 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  969    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  40.61 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  34.51 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  39.39 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  34.82 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  38.89 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  39 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  33.98 
 
 		 119 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  36.27 
 
 		 130 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  31.48 
 
 		 126 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  32.32 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  47.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  34 
 
 		 128 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1461 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  31.03 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  35.64 
 
 		 839 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  31.78 
 
 		 153 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7561  hypothetical protein  27.69 
 
 		 141 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0385242  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  34 
 
 		 128 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>