299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7032 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  100 
 
 		 215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  38.55 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  32.26 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  38.33 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  30.11 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  30.28 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  35.53 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 74 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  26.74 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  40.98 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 176 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>