218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6106 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  100 
 
 		 374 aa  760    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  51.38 
 
 		 364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  42.5 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  44.23 
 
 		 360 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 		 368 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 366 aa  292  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  44.48 
 
 		 360 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  44.26 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  44.26 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  42.47 
 
 		 369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  41.67 
 
 		 376 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  42.47 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  42.47 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  42.74 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  41.76 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  42.36 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  39.95 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  39.83 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  39.72 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  39.72 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.72 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  39.72 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  39.72 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  39.72 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  39.72 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  39.72 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  39.23 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  39 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  39 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  41.92 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  39 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  39 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  39 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.61 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  41.3 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.71 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.5 
 
 		 374 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  36.24 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  37.19 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  36.81 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  36.54 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  36.26 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  35.16 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  31.28 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  34.38 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  34.69 
 
 		 371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  36.19 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  31 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  31.69 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 378 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  30.23 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  27.25 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  29.28 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  30.88 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  29.75 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  25.34 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  28.73 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  30.98 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  30.98 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  30.98 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  26.58 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  30.99 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  26.55 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  33.45 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  29.43 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  30.6 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  30.6 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  31.23 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  30.75 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  30.75 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  30.75 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  30.75 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  29.14 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  29.43 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  29.14 
 
 		 362 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>