More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6093 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1820  aldehyde dehydrogenase  76.03 
 
 
463 aa  722    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935448  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  72.35 
 
 
463 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  72.35 
 
 
463 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  72.14 
 
 
463 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1223  Aldehyde Dehydrogenase  72.57 
 
 
462 aa  685    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  72.14 
 
 
463 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  79.27 
 
 
463 aa  761    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  71.92 
 
 
463 aa  702    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1706  Aldehyde Dehydrogenase  80.35 
 
 
463 aa  763    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
463 aa  946    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  71.49 
 
 
463 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  70.84 
 
 
463 aa  679    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2032  aldehyde dehydrogenase  74.3 
 
 
460 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3039  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  77.32 
 
 
477 aa  745    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  61.04 
 
 
463 aa  592  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
526 aa  531  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  52.38 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  51.95 
 
 
460 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  55.24 
 
 
456 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  49.78 
 
 
460 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  50.22 
 
 
456 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  49.78 
 
 
456 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  49.78 
 
 
456 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  49.56 
 
 
456 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  49.56 
 
 
456 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  49.13 
 
 
456 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
485 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  47.91 
 
 
458 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  46.58 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1090  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  47.59 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.033581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  47.57 
 
 
452 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  45.61 
 
 
466 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
457 aa  411  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0488  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.37 
 
 
468 aa  409  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.627083  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0034  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000822234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  44.08 
 
 
466 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  46.7 
 
 
452 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  43.2 
 
 
454 aa  383  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1626  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
463 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.411023  normal  0.0128015 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  47.05 
 
 
455 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  46.83 
 
 
455 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
455 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
473 aa  372  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  44.33 
 
 
464 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.64 
 
 
465 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  45.36 
 
 
455 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  44.76 
 
 
452 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
511 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07850  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
471 aa  365  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.79 
 
 
454 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
454 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
459 aa  361  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  44.27 
 
 
469 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  44.96 
 
 
454 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  43.02 
 
 
458 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  45.85 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  42.2 
 
 
460 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1103  Aldehyde Dehydrogenase  46.07 
 
 
450 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  42.76 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  43.39 
 
 
465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  42.32 
 
 
451 aa  353  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1844  aldehyde dehydrogenase  45.18 
 
 
453 aa  353  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434282  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 
469 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
469 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  42.89 
 
 
469 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  40.49 
 
 
452 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.36 
 
 
471 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
462 aa  348  8e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 
457 aa  348  8e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  43.89 
 
 
454 aa  348  9e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.45 
 
 
461 aa  347  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  45.56 
 
 
455 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2216  Aldehyde Dehydrogenase  43.42 
 
 
474 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.27 
 
 
449 aa  344  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  40.31 
 
 
452 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
470 aa  343  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  40.79 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  41.56 
 
 
458 aa  340  4e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.85 
 
 
457 aa  340  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3843  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
458 aa  339  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1446  aldehyde dehydrogenase  40.7 
 
 
465 aa  339  8e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  0.248948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  42.7 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.19 
 
 
457 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  39.47 
 
 
457 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
459 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
462 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
462 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  40.44 
 
 
457 aa  333  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
462 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  39.52 
 
 
454 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
462 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.89 
 
 
462 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  40.67 
 
 
461 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  38.77 
 
 
457 aa  330  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0914  aldehyde dehydrogenase  37.56 
 
 
457 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10340  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.82 
 
 
461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.688946  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  38.51 
 
 
457 aa  329  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>