216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5916 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  100 
 
 		 344 aa  699    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  68.62 
 
 		 346 aa  494  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  68.33 
 
 		 346 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  67.54 
 
 		 346 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  58.38 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  55.39 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  56.4 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  54.18 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  54.36 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  52.1 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  52.07 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  54.36 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  53.76 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  54.07 
 
 		 352 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  53.74 
 
 		 350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  52.91 
 
 		 352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  51.32 
 
 		 342 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  54.07 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  51.45 
 
 		 349 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  51.27 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  51.27 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  35.14 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  35.31 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  34.01 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  33.73 
 
 		 312 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  31.75 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  34.12 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  29.82 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  31.76 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 		 444 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.75 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  30.11 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  32.73 
 
 		 307 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  29.19 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.97 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  33.75 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  31.12 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  28.66 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  27.46 
 
 		 320 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  28.53 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  28.95 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  30.36 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  30.36 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  28.27 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  30.36 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  30.56 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  28.7 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  29.23 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  36.87 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  34.24 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  28.92 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  31.75 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  28.7 
 
 		 415 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  28.7 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  28.31 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  30.19 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  31.84 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.49 
 
 		 444 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  28.24 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.75 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  31.25 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  27.67 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  29.25 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  27.42 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  28.42 
 
 		 394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.87 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  30.79 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  27.66 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  28.89 
 
 		 345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  30.51 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  26.91 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  30.8 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  30.91 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  37.63 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  28.18 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  25.85 
 
 		 420 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  24.11 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  29.29 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  26.72 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  30.14 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  26.79 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  29.81 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  25.35 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  26.79 
 
 		 402 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  29.25 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  28.08 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  28.99 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  26.73 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  37.2 
 
 		 602 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.83 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  30.83 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  26.7 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6999  peptidase M19 renal dipeptidase  29.29 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.584329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  32.14 
 
 		 223 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  25.46 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  26.73 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  30.99 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>