27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5852 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  826    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  67.84 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  65.1 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  63.54 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  56.22 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  52.4 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  54.21 
 
 		 414 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  54.03 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  50.35 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  50 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  48.01 
 
 		 395 aa  346  5e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  50 
 
 		 395 aa  346  6e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  43.4 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  50 
 
 		 394 aa  322  6e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  44.78 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  44.13 
 
 		 408 aa  309  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  44.44 
 
 		 410 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  47.44 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  42.12 
 
 		 409 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  42.12 
 
 		 409 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  42.82 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  38 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  36.43 
 
 		 412 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  23.43 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  24.86 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  26.04 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  22.45 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>