More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5828 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  100 
 
 
463 aa  899  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  47.93 
 
 
483 aa  406  1e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  50.52 
 
 
469 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  52.44 
 
 
466 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.84 
 
 
469 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  53.5 
 
 
461 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  52.52 
 
 
463 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.72 
 
 
467 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.59 
 
 
471 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.17 
 
 
473 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  53.72 
 
 
467 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  50.33 
 
 
462 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  53.27 
 
 
443 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  52.63 
 
 
460 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  50.72 
 
 
443 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.49 
 
 
441 aa  363  5e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.54 
 
 
473 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.97 
 
 
469 aa  357  3e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  51.94 
 
 
466 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  48.52 
 
 
471 aa  353  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  48.34 
 
 
465 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.55 
 
 
469 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.64 
 
 
469 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  50.11 
 
 
454 aa  338  2e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  50.11 
 
 
454 aa  338  2e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.98 
 
 
465 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  4.39073e-08 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  51.88 
 
 
449 aa  328  1e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  50.58 
 
 
432 aa  328  1e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  44.33 
 
 
453 aa  328  2e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.03 
 
 
468 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  44.67 
 
 
456 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.19 
 
 
470 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  43.99 
 
 
456 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  46.19 
 
 
452 aa  316  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  46.47 
 
 
454 aa  315  1e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  44.9 
 
 
455 aa  313  3e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  48.55 
 
 
450 aa  312  7e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  49.35 
 
 
450 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  45.98 
 
 
444 aa  310  3e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.33 
 
 
467 aa  309  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  47.33 
 
 
431 aa  304  2e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  48.15 
 
 
450 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  48.82 
 
 
447 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  46.39 
 
 
417 aa  298  9e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  40.67 
 
 
442 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  44.47 
 
 
453 aa  292  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  42.83 
 
 
456 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  47.48 
 
 
418 aa  286  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.45 
 
 
450 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  44.65 
 
 
451 aa  279  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  44.39 
 
 
445 aa  279  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.45 
 
 
447 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  48.89 
 
 
428 aa  277  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  43.16 
 
 
456 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  45.18 
 
 
446 aa  273  4e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.8 
 
 
441 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.37 
 
 
457 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  47.24 
 
 
454 aa  263  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  44.91 
 
 
452 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  38.74 
 
 
507 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  35.48 
 
 
428 aa  166  1e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.57 
 
 
404 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  32.18 
 
 
383 aa  153  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.19 
 
 
387 aa  152  9e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.31 
 
 
387 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.45 
 
 
395 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.11 
 
 
393 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  29.46 
 
 
385 aa  148  2e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  28.97 
 
 
379 aa  146  8e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  29.57 
 
 
393 aa  146  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.46 
 
 
392 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.03 
 
 
388 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.95 
 
 
386 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.41 
 
 
393 aa  142  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  28.95 
 
 
396 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  28.95 
 
 
396 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.51 
 
 
389 aa  141  2e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  28.95 
 
 
396 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  29.38 
 
 
394 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  27.56 
 
 
396 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  30.3 
 
 
401 aa  135  2e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  27.47 
 
 
392 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.57 
 
 
472 aa  134  4e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.76 
 
 
401 aa  134  4e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.72 
 
 
382 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.26 
 
 
397 aa  132  1e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  27.32 
 
 
392 aa  132  1e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  29.57 
 
 
399 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  29.48 
 
 
376 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  30.77 
 
 
382 aa  130  4e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.27 
 
 
390 aa  129  8e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  30.64 
 
 
401 aa  128  2e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.57 
 
 
400 aa  127  4e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  28.07 
 
 
376 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.13 
 
 
390 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  28.49 
 
 
398 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  27.27 
 
 
390 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  29.48 
 
 
390 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  28.82 
 
 
390 aa  122  2e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  28.06 
 
 
408 aa  122  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>