143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5724 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5724  Glycosyl transferase  100 
 
 
425 aa  852    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0009  glycosyl transferase family 28  36.64 
 
 
423 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.463057 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0057  glycosyl transferase family 28  37.67 
 
 
427 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0362  sterol 3-beta-glucosyltransferase  35.56 
 
 
417 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0442187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2083  sterol 3-beta-glucosyltransferase  38.15 
 
 
420 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3800  sterol 3-beta-glucosyltransferase  38.6 
 
 
413 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.306929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4642  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 
413 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3721  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 
413 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0485  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 
451 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.716398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4524  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
421 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1350  glycosyl transferase family 28  37.82 
 
 
428 aa  230  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4758  glycosyl transferase family 28  37.86 
 
 
418 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5461  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
415 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5942  glycosyl transferase family 28  38.34 
 
 
413 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547483  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2387  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
413 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3605  sterol 3-beta-glucosyltransferase  37.83 
 
 
413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2034  hypothetical protein  36.19 
 
 
412 aa  216  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.906883  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3714  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  33.33 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0168  sterol 3-beta-glucosyltransferase  37.02 
 
 
427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.398755  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3452  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 
414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2593  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 
412 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0690  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  32.78 
 
 
419 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0718  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  32.78 
 
 
419 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194717  normal  0.0259108 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04601  Sterol 3-beta-glucosyltransferase (EC 2.4.1.173)(Autophagy-related protein 26) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4C9]  33.56 
 
 
1396 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.63274  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01607  UDP-glucose,sterol transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06750)  32.77 
 
 
1139 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.144836  normal  0.210264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5006  sterol 3-beta-glucosyltransferase  36.45 
 
 
407 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.794532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8827  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  36.26 
 
 
405 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177267  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00487  sterol glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04880)  32.56 
 
 
749 aa  199  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2852  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0177  sterol 3-beta-glucosyltransferase  34.62 
 
 
427 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03260  sterol 3-beta-glucosyltransferase, putative  33.64 
 
 
1220 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3043  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  32.31 
 
 
419 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0373  sterol 3-beta-glucosyltransferase  31.46 
 
 
417 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04500  UDP-glucose:sterol glucosyltransferase, putative  32.19 
 
 
1581 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_191  Sterol 3-beta-glucosyltransferase (Autophagy-related protein 26) (UDP-glycosyltransferase 51)  29.77 
 
 
1249 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0907  sterol 3-beta-glucosyltransferase  33.72 
 
 
416 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.499452  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1915  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  31.93 
 
 
414 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2696  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  30.54 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_1174  predicted protein  30.9 
 
 
434 aa  166  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4844  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  32.04 
 
 
434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3770  sterol 3-beta-glucosyltransferase  34.62 
 
 
419 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2894  sterol 3-beta-glucosyltransferase  31.48 
 
 
435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2291  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  33.64 
 
 
415 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0972144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4841  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  31.18 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0113  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  30.48 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.015765  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10600  glycosyl transferase, UDP-glucuronosyltransferase  27.02 
 
 
425 aa  135  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2526  glycosyl transferase family 28  34.02 
 
 
412 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00117943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5814  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0073  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1037  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  28.39 
 
 
462 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3732  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.303192  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1800  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
430 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3101  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61797  normal  0.564364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5179  glycosyl transferase  31.76 
 
 
413 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4779  glycosyl transferase family 28  27.42 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.514672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11559  glycosyltransferase  27.13 
 
 
426 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3115  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
421 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3175  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
421 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11557  glycosyltransferase  27.25 
 
 
414 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3897  glycosyl transferase family 28  29.93 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1906  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
403 aa  89.7  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  27.83 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1905  glycosyl transferase family protein  21.96 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  27.79 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  28.24 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6794  glycosyl transferase family 28  25.39 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0006  glycosyl transferase family 28  26.38 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3126  glycosyl transferase  36 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  27.38 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  24.94 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.65 
 
 
475 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.65 
 
 
475 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3273  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
427 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0719433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5095  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
427 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509328  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5187  glycosyl transferase family protein  29.16 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00893984  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2048  glycosyl transferase family 28  26.88 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2966  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2036  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
427 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4922  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
435 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0558  glycosyl transferase family protein  29.16 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04310  UDP-glucose,sterol transferase  25 
 
 
796 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000406767  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5871  glycosyl transferase family 28  38 
 
 
139 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989853  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
409 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  32.39 
 
 
416 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.77 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.27 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.43 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.43 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1457  glycosyl transferase family 28  24.4 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>