37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5600 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  783    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  31.8 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  27.61 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  25.44 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  25.67 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  26.37 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  22.78 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  26.35 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  22.7 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  27.21 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  27.21 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  27.21 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  27.59 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  27.59 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.34 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  23 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  20.85 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  25.38 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  29.01 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.08 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  23.36 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  27.81 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  21.59 
 
 		 324 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  25.38 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  27.61 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  25.17 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  25 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  28.46 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  25.25 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  25.41 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  30.33 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.4 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  24.4 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  23.43 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  28.8 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>