More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5482 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5482  lipase esterase  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000559952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3354  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  63.53 
 
 		 270 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.0196184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3097  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  62.55 
 
 		 271 aa  349  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.653129  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2879  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.34 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.571026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0870  putative esterase protein  42.4 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2561  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.02 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1296  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.7 
 
 		 303 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3430  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.15 
 
 		 297 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5138  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.43 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0064  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.89 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0321  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.57 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.92 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.117524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1361  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.06 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335294 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.09 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.39 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.78 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4336  esterase/lipase/thioesterase  36.2 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4868  esterase/lipase/thioesterase  35.62 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00085795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.05 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.49 
 
 		 628 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  35.38 
 
 		 311 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.75 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1791  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.02 
 
 		 281 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  35.43 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.05 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.32 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.32 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.29 
 
 		 314 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_003296  RS02619  lipase protein  36.5 
 
 		 357 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  31.7 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.84 
 
 		 370 aa  92.4  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.73 
 
 		 313 aa  92  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  31.84 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2890  putative lipase/carboxylesterase protein  35.68 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.11 
 
 		 311 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3830  esterase/lipase/thioesterase  34.35 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.418878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  35.38 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.65 
 
 		 308 aa  89.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  36.6 
 
 		 305 aa  89  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.58 
 
 		 301 aa  89  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.31 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3668  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.56 
 
 		 317 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.96 
 
 		 371 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.2 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.74 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2107  hypothetical protein  34.01 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1004  heroin esterase  32.58 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.38 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.29 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.5 
 
 		 363 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.975895 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4336  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.5 
 
 		 363 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.38701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.04 
 
 		 320 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.04 
 
 		 311 aa  85.9  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.48 
 
 		 323 aa  85.9  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.91 
 
 		 286 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0294  esterase/lipase/thioesterase  35.41 
 
 		 286 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.13 
 
 		 320 aa  85.5  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3013  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.41 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5353  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.41 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4917  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.18 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.98 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23980  esterase/lipase  29.56 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.48 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.38 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4661  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.74 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.879161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.5 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.67 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3372  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.96 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0415  putative carboxylesterase  34.01 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1467  putative carboxylesterase  34.01 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1839  lipase-like protein LlpE  34.01 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2143  putative carboxylesterase  34.01 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0826  putative carboxylesterase  34.01 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3484  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.8 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05501  lipase/esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01050)  29.82 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.737319  normal  0.319668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  30.14 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  32.49 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4633  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.36 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.416952  normal  0.230577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.59 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  29.06 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  34.22 
 
 		 884 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.02 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.1 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.34 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  28.63 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0512  putative carboxylesterase  33.5 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.42 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.42 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.42 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2733  carboxylesterase  30.54 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0800200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  30.2 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.84 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  33.33 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>