244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5463 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5463  osmotically inducible protein OsmC  100 
 
 		 143 aa  286  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3472  OsmC family protein  72.54 
 
 		 143 aa  219  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.359204  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3760  Peroxiredoxin  73.57 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00710  osmotically inducible protein OsmC  68.31 
 
 		 151 aa  196  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0059  osmotically inducible protein OsmC  69.29 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0107  OsmC family protein  70.71 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0089  OsmC family protein  70 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0104  OsmC family protein  70 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3986  OsmC-like protein  68.12 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.347334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0104  OsmC family protein  69.29 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000509604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1401  OsmC-like protein  71.43 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1994  OsmC family protein  64.08 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1421  OsmC-like protein  70.63 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01800  OsmC-like protein  67.14 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0270065  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5086  OsmC family protein  64.79 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.822138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4674  OsmC family protein  71.2 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2450  OsmC family protein  65.49 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2041  OsmC family protein  61.97 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.811079  normal  0.341975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3199  OsmC family protein  60.71 
 
 		 140 aa  176  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0097  OsmC-like protein  59.15 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  60.56 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4453  OsmC family protein  59.29 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1780  peroxiredoxin OsmC  61.27 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.778339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1677  peroxiredoxin OsmC  61.27 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1740  peroxiredoxin OsmC  61.27 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1679  peroxiredoxin OsmC  61.27 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1602  peroxiredoxin OsmC  61.27 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.746338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01440  osmotically inducible, stress-inducible membrane protein  61.27 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2165  OsmC family protein  61.27 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1567  peroxiredoxin OsmC  61.27 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01452  hypothetical protein  61.27 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.219956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1664  peroxiredoxin OsmC  61.27 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2175  OsmC family protein  61.27 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2091  Peroxiredoxin  61.27 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.481334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0152  osmotically inducible protein  59.15 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1158  OsmC-like protein  58.45 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1745  peroxiredoxin OsmC  61.27 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2094  peroxiredoxin OsmC  60.56 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2238  OsmC family protein  63.36 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8088  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0585  osmotically inducible protein OsmC  63.36 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3133  OsmC family protein  64.08 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0138842  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1538  OsmC-like protein  59.69 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0488  OsmC family protein  61.07 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.358629  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0303  OsmC-like protein  55.71 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.263241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1008  OsmC family protein  56.94 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2579  OsmC family protein  56.12 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2067  OsmC-like protein  55 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2261  OsmC family protein  56.12 
 
 		 143 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.427996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  55.32 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3664  Peroxiredoxin  55.56 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444391  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2304  OsmC family protein  56.12 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  hitchhiker  0.00777358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3272  osmotically inducible protein C  55.63 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0007  OsmC family protein  55.32 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4150  OsmC family protein  55.32 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02004  peroxiredoxin OsmC  55.4 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0580  OsmC-like protein  54.23 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207251  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5465  OsmC family protein  55.73 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1145  putative OsmC-like protein  55.73 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0144  OsmC family protein  51.77 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3669  OsmC family protein  57.04 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0742  OsmC-like protein  52.82 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0924  OsmC family protein  55.32 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  51.06 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1691  peroxiredoxin OsmC  64.76 
 
 		 116 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2374  OsmC-like protein  54.84 
 
 		 142 aa  136  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0467379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03308  osmotically inducible protein  53.38 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0381  OsmC family protein  51.94 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.639142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7145  OsmC family protein  50 
 
 		 138 aa  133  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3240  OsmC-like protein  50 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2716  peroxiredoxin, OsmC subfamily  54.96 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.126465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2252  osmotically inducible protein  47.52 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.599611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4026  OsmC family protein  48.95 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0059  redox protein, regulator of disulfide bond formation  49.64 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00217443  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5223  OsmC family protein  54.2 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610628  normal  0.18726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2339  OsmC family protein  47.86 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0956  OsmC family protein  45.83 
 
 		 145 aa  123  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1364  OsmC family protein  50 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.680071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2726  peroxiredoxin, OsmC subfamily  43.66 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.102217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0962  OsmC family protein  51.8 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2586  OsmC family protein  47.18 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0526  OsmC-like protein protein  42.64 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.455269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0142  OsmC-like protein  45.14 
 
 		 146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5540  peroxiredoxin, OsmC subfamily  48.91 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1108  OsmC family protein  48.92 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1608  OsmC family protein  46.53 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.486647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2185  OsmC family protein  48.53 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1350  OsmC family protein  47.29 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2899  OsmC family protein  44.12 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4020  OsmC family protein  44.76 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216062  normal  0.10554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5772  OsmC family protein  44.19 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7122  OsmC family protein  45.32 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1603  OsmC family protein  41.96 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2252  OsmC family protein  43.36 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4793  peroxiredoxin, OsmC subfamily  46.67 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32410  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  44.44 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1609  OsmC family protein  41.26 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6705  OsmC-like protein  41.96 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252159  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1962  OsmC family protein  44.06 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000828142  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0859  OsmC family protein  45.93 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407191  normal  0.674013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0122  OsmC family protein  45.93 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>