More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5383 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 784 aa  1567    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  46.29 
 
 		 779 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.2 
 
 		 783 aa  608  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  46.6 
 
 		 746 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1007 aa  303  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  36.81 
 
 		 1077 aa  293  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 657 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 539 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 618 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 641 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 869 aa  282  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 530 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 530 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 901 aa  273  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 657 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 		 637 aa  272  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 697 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 948 aa  270  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 528 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 528 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.9 
 
 		 404 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 639 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 602 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 529 aa  264  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  32.96 
 
 		 685 aa  260  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.51 
 
 		 935 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 526 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 657 aa  257  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 502 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  35.7 
 
 		 938 aa  251  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  32.25 
 
 		 682 aa  250  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 878 aa  249  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 833 aa  248  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  37.45 
 
 		 1317 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 633 aa  245  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 1046 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.68 
 
 		 823 aa  241  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 989 aa  240  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 989 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 939 aa  238  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 845 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 653 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 881 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1041 aa  234  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 		 1193 aa  230  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 		 1193 aa  230  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1046  histidine kinase  37.29 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00874969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 1167 aa  228  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 738 aa  228  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 971 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1068 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 767 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 643 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 780 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  29.03 
 
 		 943 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 679 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  32.16 
 
 		 1323 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 827 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.71 
 
 		 1535 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 756 aa  219  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 870 aa  219  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 720 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 1090 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  34.64 
 
 		 910 aa  217  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 1090 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  35.68 
 
 		 998 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 1323 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1009 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 1350 aa  215  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 652 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 674 aa  214  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 970 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 383 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 858 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 652 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 642 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.56 
 
 		 882 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 383 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 642 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3685  histidine kinase  33.14 
 
 		 510 aa  211  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 		 841 aa  210  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 935 aa  210  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 		 1222 aa  210  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 860 aa  210  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 1352 aa  210  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 		 995 aa  210  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 		 1116 aa  210  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.7 
 
 		 1380 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.98 
 
 		 1371 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1226 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 765 aa  208  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 747 aa  208  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 940 aa  208  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 721 aa  207  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3120  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 752 aa  207  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 945 aa  207  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  30.94 
 
 		 827 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 929 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>