58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5337 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5337  aldolase  100 
 
 		 304 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  71.72 
 
 		 299 aa  454  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  71.38 
 
 		 300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  44.37 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  27.56 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.37 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.26 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  25.85 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.85 
 
 		 336 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.7 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.25 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  26.04 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  26.04 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  25.69 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  25.69 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.05 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  25.69 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.84 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.84 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.02 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.68 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  25.66 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.66 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  25.66 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  23.15 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.6 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  23.15 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.584894 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  24.04 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.84 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  23.15 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  23.15 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  23.15 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  23.15 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  23.65 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.74 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.57 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000016799  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  22.3 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  25.85 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.83 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.34 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  26.95 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  22.47 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.66 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  36.84 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  25.18 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  32.77 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  41.25 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.97 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1277  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.4 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  27.41 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  30.51 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  34.18 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  36.25 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  26.67 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3967  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.46 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0622201  normal  0.0127829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.68 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>