More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5294 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  100 
 
 		 549 aa  1111    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  63.11 
 
 		 547 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  61.94 
 
 		 558 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  60.86 
 
 		 557 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  60.98 
 
 		 585 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  56.19 
 
 		 544 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  58.37 
 
 		 534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  57.14 
 
 		 538 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  56.36 
 
 		 554 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  57.17 
 
 		 540 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  56.82 
 
 		 534 aa  591  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  56.25 
 
 		 539 aa  585  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  56.29 
 
 		 552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  57.17 
 
 		 538 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  57.03 
 
 		 534 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  55.83 
 
 		 552 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  56.31 
 
 		 552 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  52.74 
 
 		 541 aa  559  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  53.54 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  53.21 
 
 		 546 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  51.21 
 
 		 545 aa  558  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  55.95 
 
 		 550 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  53.58 
 
 		 545 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  54.7 
 
 		 560 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  55.37 
 
 		 552 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.89 
 
 		 540 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.18 
 
 		 548 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  50.93 
 
 		 542 aa  535  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  54 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  52.06 
 
 		 553 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  54.3 
 
 		 557 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  55 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  51.41 
 
 		 552 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  50.47 
 
 		 549 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  50.94 
 
 		 546 aa  501  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  48.96 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  50.74 
 
 		 556 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  49.81 
 
 		 532 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.03 
 
 		 611 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  47.42 
 
 		 611 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 623 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  47.15 
 
 		 612 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 		 623 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.97 
 
 		 534 aa  485  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 		 623 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  44.29 
 
 		 564 aa  484  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  47.91 
 
 		 623 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  47.76 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.67 
 
 		 626 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 539 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 623 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 623 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  47.45 
 
 		 629 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  47.23 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.68 
 
 		 612 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  47.68 
 
 		 612 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  48.53 
 
 		 562 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  46 
 
 		 609 aa  475  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  48.2 
 
 		 542 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 		 632 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  45.77 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  45.96 
 
 		 615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  48.61 
 
 		 568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  48.11 
 
 		 619 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  46.7 
 
 		 623 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  46.7 
 
 		 623 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  46.7 
 
 		 623 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  46.52 
 
 		 609 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 		 623 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  45.88 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 		 637 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  46.8 
 
 		 573 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 		 623 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  46.8 
 
 		 583 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.97 
 
 		 617 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 609 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  46.49 
 
 		 534 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  46.36 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  46.01 
 
 		 593 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.79 
 
 		 632 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  45.38 
 
 		 640 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.83 
 
 		 633 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  46.87 
 
 		 539 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  46.68 
 
 		 545 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  44.03 
 
 		 623 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 		 629 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  48.02 
 
 		 625 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  46.14 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.55 
 
 		 640 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  47.32 
 
 		 543 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  44.52 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 627 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  46.15 
 
 		 613 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  46.15 
 
 		 545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.87 
 
 		 643 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  46.69 
 
 		 543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.7 
 
 		 531 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>