189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5247 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  81 
 
 		 101 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  85.71 
 
 		 101 aa  160  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  74 
 
 		 99 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  72.73 
 
 		 101 aa  147  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  78.35 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  78.35 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  81.63 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  76.29 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5170  PhnA-like protein  66.33 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00732124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  66.67 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  71.13 
 
 		 99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  72.06 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  68.66 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  67.16 
 
 		 73 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  67.65 
 
 		 72 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  65.67 
 
 		 73 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  66.18 
 
 		 72 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  50 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  47.57 
 
 		 112 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.98 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.55 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  46.6 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  64.71 
 
 		 72 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  63.24 
 
 		 72 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  48.45 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  43.69 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  43.69 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  62.5 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  62.32 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  44.79 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.02 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.83 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.45 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.88 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.15 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.32 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.45 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  49 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  49 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  41.75 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  49 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  49 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  49 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  49 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  46.59 
 
 		 114 aa  87  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  64.06 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  40.78 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  46.88 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  47 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  47.83 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  47.83 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.88 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  46.15 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  47.31 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  47 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  47 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  47 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.69 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  47 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.69 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.66 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.69 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.65 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 113 aa  84.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  41.67 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.52 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  45.36 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.47 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  60.29 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.79 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.72 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  45.36 
 
 		 111 aa  83.6  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.86 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  41.75 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.75 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.83 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.55 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.63 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.24 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.75 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.75 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  42.72 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  45.83 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>