More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5176 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  100 
 
 		 429 aa  874    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.21 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  55.45 
 
 		 457 aa  474  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  54.23 
 
 		 458 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.63 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  52.85 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  52.51 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  53.33 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  53.36 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.36 
 
 		 441 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  53.21 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.74 
 
 		 445 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  54.13 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  51.03 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  53.7 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.98 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.49 
 
 		 460 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  53.65 
 
 		 451 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.49 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.28 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.3 
 
 		 456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.05 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  51.86 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  51.6 
 
 		 457 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  53.81 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  51.03 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  51.48 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  51.48 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  51.99 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  52.66 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  50.23 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  49.66 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  49.89 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  50 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  50 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  49.89 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  48.74 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  49.89 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  50.93 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  49.3 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  49.42 
 
 		 474 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  49.77 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.62 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  47.06 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.11 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.48 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.54 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.45 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  48.28 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  48.39 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  48.28 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  49.31 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.02 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  48.51 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.71 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  47.82 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.69 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  48.38 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  48.39 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  46.31 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  47.1 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.16 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.45 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.64 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.17 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  45.39 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.85 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.16 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  48.17 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  47.91 
 
 		 1121 aa  383  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.21 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.06 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  50.23 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  47.45 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  46.5 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  46.33 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  46.42 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3862  flavin-dependent oxidoreductase  46.76 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691783  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5875  flavin-dependent oxidoreductase  45.6 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  45.39 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1532  flavin-dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  47.47 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4430  flavin-dependent oxidoreductase  45.37 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2001  putative monooxygenase  44.7 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  44.7 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  45.98 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3053  putative monooxygenase  44.7 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1311  putative monooxygenase  44.7 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3181  putative monooxygenase  44.7 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.12 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  44.93 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1023  putative monooxygenase  44.7 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0217673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0738  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.31 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  45.96 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  45.31 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  45.39 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2404  flavin-dependent oxidoreductase  45.31 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878238  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2289  putative monooxygenase  44.47 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0563  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.07 
 
 		 440 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0232  putative monooxygenase  44.47 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>