More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4361 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  57.93 
 
 
564 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  58.17 
 
 
567 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4226  General substrate transporter  75.28 
 
 
628 aa  941    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.162126 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  77.02 
 
 
632 aa  948    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  57.33 
 
 
574 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  59.8 
 
 
552 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  57.42 
 
 
565 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  61.51 
 
 
557 aa  709    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  61.76 
 
 
552 aa  722    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1334  major facilitator transporter  60.86 
 
 
568 aa  706    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  59.61 
 
 
552 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  76.86 
 
 
632 aa  948    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  57.01 
 
 
565 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  57.53 
 
 
567 aa  661    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  58.16 
 
 
564 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0062  major facilitator transporter  72.13 
 
 
630 aa  858    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3902  General substrate transporter  75.76 
 
 
628 aa  948    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.207036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  59.35 
 
 
564 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3289  major facilitator transporter  72.36 
 
 
625 aa  912    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4361  MFS permease  100 
 
 
627 aa  1262    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  77.78 
 
 
629 aa  994    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  59.48 
 
 
552 aa  700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  56.5 
 
 
567 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  66.23 
 
 
560 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  66.15 
 
 
553 aa  603  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  67.47 
 
 
556 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5595  general substrate transporter  60.11 
 
 
560 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  67.19 
 
 
558 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  57.59 
 
 
552 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  69.44 
 
 
552 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  58.33 
 
 
552 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1561  major facilitator transporter  65.62 
 
 
556 aa  581  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  52.02 
 
 
563 aa  578  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  58.52 
 
 
552 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  57.41 
 
 
552 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  57.59 
 
 
552 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  58.52 
 
 
552 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  65.6 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  65.83 
 
 
552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  65.83 
 
 
552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  65.6 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  65.6 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  65.6 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  65.83 
 
 
552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  58.27 
 
 
552 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  65.83 
 
 
552 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  55.33 
 
 
554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  52.97 
 
 
556 aa  571  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  57.96 
 
 
552 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0851  MFS family sugar transporter  63.09 
 
 
556 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734503  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  62.84 
 
 
554 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2379  general substrate transporter  62.75 
 
 
573 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3353  major facilitator transporter  68.87 
 
 
563 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  49.36 
 
 
563 aa  549  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  49.51 
 
 
540 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0835  general substrate transporter  62.84 
 
 
554 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0740201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3756  General substrate transporter  66.44 
 
 
563 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3839  General substrate transporter  66.67 
 
 
563 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.241641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3146  general substrate transporter  62.11 
 
 
559 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3698  major facilitator superfamily transporter  66.44 
 
 
563 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4821  general substrate transporter  54.61 
 
 
554 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2965  general substrate transporter  62.56 
 
 
557 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338503  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2569  major facilitator transporter  63.06 
 
 
558 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409039  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2188  general substrate transporter  48.79 
 
 
561 aa  526  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3296  major facilitator transporter  60.79 
 
 
559 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3352  major facilitator transporter  63.89 
 
 
565 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1411  general substrate transporter  66.75 
 
 
549 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.966407  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6348  major facilitator superfamily MFS_1  54.61 
 
 
577 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5178  major facilitator transporter  54.24 
 
 
577 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3972  major facilitator superfamily MFS_1  60.22 
 
 
553 aa  512  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.727747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2565  major facilitator transporter  55.03 
 
 
578 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  59.51 
 
 
558 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2788  major facilitator superfamily MFS_1  54.85 
 
 
578 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2497  major facilitator superfamily MFS_1  53.64 
 
 
562 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  53.52 
 
 
554 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1303  major facilitator superfamily MFS_1  56.29 
 
 
568 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  53.32 
 
 
554 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  58.58 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  58.11 
 
 
539 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  58.11 
 
 
539 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  58.11 
 
 
539 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1946  major facilitator transporter  61.76 
 
 
541 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16410  putative MFS transporter  62.01 
 
 
539 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1427  MFS family transporter  62.01 
 
 
539 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6133  major facilitator superfamily MFS_1  53.46 
 
 
552 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376404  normal  0.0270764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3981  major facilitator superfamily MFS_1  51.47 
 
 
552 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6117  major facilitator superfamily MFS_1  51.26 
 
 
552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154468  normal  0.620567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0047  general substrate transporter  51.25 
 
 
553 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8529  General substrate transporter  52.27 
 
 
542 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  59.57 
 
 
525 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  53.31 
 
 
511 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  58.61 
 
 
539 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  50.12 
 
 
525 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  59.55 
 
 
514 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  59.63 
 
 
487 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1409  major facilitator transporter  58.02 
 
 
498 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2061  major facilitator superfamily MFS_1  55.71 
 
 
526 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  49.76 
 
 
527 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2995  major facilitator superfamily MFS_1  53.48 
 
 
494 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000112139  normal  0.562927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  55.52 
 
 
481 aa  362  8e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>