More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4345 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  85.89 
 
 		 241 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  84.58 
 
 		 241 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  82.57 
 
 		 241 aa  417  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  84.58 
 
 		 241 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3116  acetoacetyl-CoA reductase  86.67 
 
 		 241 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.937548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  80.5 
 
 		 240 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  80.5 
 
 		 240 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  75.52 
 
 		 241 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  74.58 
 
 		 241 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  74.58 
 
 		 241 aa  367  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  74.17 
 
 		 241 aa  363  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  76.05 
 
 		 241 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  73.64 
 
 		 241 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3375  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  71.67 
 
 		 240 aa  364  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  72.61 
 
 		 241 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  72.92 
 
 		 241 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  73.53 
 
 		 241 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  72.08 
 
 		 241 aa  358  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  73.44 
 
 		 240 aa  358  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  74.06 
 
 		 240 aa  357  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  72.2 
 
 		 240 aa  351  7e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0492  acetoacetyl-CoA reductase  70.95 
 
 		 240 aa  350  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  73.11 
 
 		 242 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  72.27 
 
 		 242 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  72.27 
 
 		 242 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  67.5 
 
 		 241 aa  331  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  68.62 
 
 		 242 aa  328  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  67.36 
 
 		 242 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  66.95 
 
 		 242 aa  324  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  66.95 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  65 
 
 		 240 aa  318  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  65.13 
 
 		 242 aa  315  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  63.49 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  62.92 
 
 		 240 aa  311  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  62.92 
 
 		 240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  61.25 
 
 		 240 aa  301  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  62.08 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  60.42 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  63.45 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  60 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.42 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  58.4 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.88 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  58.61 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 		 247 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  49.58 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  49.58 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  49.38 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  49.38 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  51.45 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  47.33 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.77 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.67 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  51.65 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  49.58 
 
 		 248 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  49.17 
 
 		 248 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  51.65 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  49.17 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  49.17 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  49.17 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  49.17 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  52.44 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  49.58 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  51.87 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  53.28 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  56.79 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  53.33 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.38 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 		 248 aa  237  9e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 		 268 aa  234  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.5 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  52.28 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  51.82 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  48.5 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  49.39 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.62 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  52.5 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.08 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.08 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.65 
 
 		 245 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  50.41 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  52.7 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.3 
 
 		 245 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  53.11 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  50.62 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  52.08 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  52.03 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  51.25 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  46.47 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  51.22 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>