More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4333 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4333  porin  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  79.36 
 
 
221 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  78.9 
 
 
221 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  71.69 
 
 
221 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  75.34 
 
 
221 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  73.06 
 
 
243 aa  269  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  73.06 
 
 
220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  63.3 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  56.62 
 
 
218 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  56.82 
 
 
224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  52.24 
 
 
224 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  53.92 
 
 
218 aa  188  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  47.3 
 
 
222 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  50.45 
 
 
219 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  50.45 
 
 
219 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  55.45 
 
 
221 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  46.02 
 
 
215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  45.09 
 
 
231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  52.97 
 
 
236 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  47.32 
 
 
219 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  47.32 
 
 
219 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  47.32 
 
 
219 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  47.32 
 
 
219 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  47.32 
 
 
219 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  47.32 
 
 
219 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  49.27 
 
 
225 aa  178  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  48.44 
 
 
241 aa  177  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  46.88 
 
 
219 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 
220 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 
220 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 
220 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 
220 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  46.36 
 
 
220 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  49.78 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  48.84 
 
 
224 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  49.06 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  49.28 
 
 
225 aa  171  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  49.33 
 
 
240 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  51.35 
 
 
224 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  49.11 
 
 
240 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  49.33 
 
 
236 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  49.33 
 
 
247 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  47.09 
 
 
237 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  50.9 
 
 
222 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  47.32 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  58.7 
 
 
237 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  58.7 
 
 
237 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  48.2 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  47.75 
 
 
229 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  47.06 
 
 
219 aa  161  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  57.97 
 
 
222 aa  161  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  47.06 
 
 
219 aa  161  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  42.6 
 
 
223 aa  161  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  49.54 
 
 
228 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  46.64 
 
 
222 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  46.61 
 
 
219 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  45.93 
 
 
224 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  47.44 
 
 
226 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  49.07 
 
 
230 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  49.07 
 
 
230 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  48.61 
 
 
230 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  45.83 
 
 
228 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  47.62 
 
 
226 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  47.91 
 
 
220 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  40.36 
 
 
228 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  40.36 
 
 
228 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  39.46 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  52.9 
 
 
222 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  45.87 
 
 
215 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  49.54 
 
 
227 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  44.5 
 
 
205 aa  141  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  49.07 
 
 
230 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  42.15 
 
 
222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  44.08 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  44.39 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
218 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  42.99 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  43.18 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  45.75 
 
 
248 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  42.41 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  42.41 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  44.24 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.49 
 
 
212 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  39.9 
 
 
225 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.36 
 
 
218 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  41.97 
 
 
294 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  42.94 
 
 
216 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  42.94 
 
 
216 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  52.85 
 
 
215 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  52.85 
 
 
215 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  52.85 
 
 
215 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  52.85 
 
 
215 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  52.85 
 
 
215 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  52.85 
 
 
215 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  53.66 
 
 
261 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>