239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4331 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  100 
 
 		 384 aa  752    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  64.12 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  63.68 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  58.84 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  59.63 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  60.47 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  47.48 
 
 		 391 aa  309  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  36.23 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 403 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  40.72 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.62 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  37.99 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  36.66 
 
 		 417 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 389 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.29 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 391 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  33.71 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 465 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  34.17 
 
 		 378 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 383 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  33.89 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  33.89 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  33.89 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  33.89 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  33.89 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  33.88 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  33.61 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 419 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 392 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  33.42 
 
 		 396 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  34.58 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 390 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  37.97 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  40.81 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  37.68 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  31.94 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  37.68 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  37.68 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  37.68 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  32.09 
 
 		 403 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 373 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  35.95 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  32.35 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>