70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4235 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  66.06 
 
 		 220 aa  295  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  71.93 
 
 		 222 aa  274  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  63.37 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  59.26 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  58.8 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  58.22 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  60.22 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  45.56 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.23 
 
 		 339 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.83 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.04 
 
 		 317 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  39.11 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.31 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.8 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  43.02 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.23 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.76 
 
 		 313 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.57 
 
 		 332 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.83 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.63 
 
 		 302 aa  131  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.06 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.32 
 
 		 315 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.32 
 
 		 315 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.44 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.61 
 
 		 313 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.03 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.92 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  33.95 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.95 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.55 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.11 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  32.37 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.13 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.32 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  27.8 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.65 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.81 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.05 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.95 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.37 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.14 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.85 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1394  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.68 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.86 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.14 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.69 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.52 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.25 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  23.67 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.94 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.42 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.49 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  22.3 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.25 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.17 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.79 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.25 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.6 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.56 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  27.56 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.35 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3255  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.41 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00308863  hitchhiker  0.000000000848281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.22 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  29.08 
 
 		 206 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.76 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  22.17 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  22.76 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>