More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4180 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  81.46 
 
 		 235 aa  341  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  80 
 
 		 235 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  81.22 
 
 		 239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  70.59 
 
 		 242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  73.85 
 
 		 246 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  72.28 
 
 		 242 aa  287  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  72.28 
 
 		 242 aa  287  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  72.31 
 
 		 247 aa  284  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  73.33 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  71.07 
 
 		 235 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  71.79 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  70 
 
 		 230 aa  280  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  71.28 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  69.74 
 
 		 230 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  69.74 
 
 		 260 aa  270  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  69.23 
 
 		 227 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  65.99 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  67.53 
 
 		 235 aa  256  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  66.15 
 
 		 231 aa  254  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  67.18 
 
 		 228 aa  254  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  66.15 
 
 		 231 aa  254  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  73.53 
 
 		 174 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  69.54 
 
 		 237 aa  249  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  64.1 
 
 		 230 aa  242  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  62.37 
 
 		 237 aa  237  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  59.49 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  58.88 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  61.5 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  54.03 
 
 		 252 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  56.41 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  56.7 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  58.97 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  55.33 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  54.87 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  56.35 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  53.77 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  59.3 
 
 		 229 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  54.04 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  55.67 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  58.79 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  57.89 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  52.43 
 
 		 246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  52.43 
 
 		 242 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  52.43 
 
 		 242 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  60.91 
 
 		 234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  52.43 
 
 		 242 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  56.19 
 
 		 226 aa  211  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  55.15 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  57 
 
 		 227 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  58.29 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  53.3 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  53.3 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  53.3 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  53.09 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  57.22 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  54.31 
 
 		 249 aa  207  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  56.7 
 
 		 228 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  54.64 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  56.7 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  54.12 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  56.19 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  54.64 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  52.58 
 
 		 238 aa  204  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  55.67 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  54.69 
 
 		 249 aa  204  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  56.92 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  52.58 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  50.48 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  51.03 
 
 		 241 aa  203  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  55.9 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  50.52 
 
 		 232 aa  202  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  53.09 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  52.58 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  51.56 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  52.58 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  55.26 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  52.04 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  51.03 
 
 		 224 aa  195  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  51.03 
 
 		 228 aa  195  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  51.03 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  52.08 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  50.49 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  53.37 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  54.5 
 
 		 239 aa  193  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.26 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  51.26 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  55.21 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.26 
 
 		 228 aa  192  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.75 
 
 		 228 aa  192  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  56.77 
 
 		 227 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.26 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  52.85 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.26 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.26 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.26 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  48.73 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.5 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.5 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>