246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4174 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4174  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  100 
 
 
100 aa  209  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4051  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56 
 
 
101 aa  127  7e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3728  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.57 
 
 
101 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341659  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3071  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  57 
 
 
105 aa  119  2e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0248  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  59.14 
 
 
99 aa  113  8e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.38 
 
 
100 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0568547  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2809  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  52.63 
 
 
101 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.891802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2524  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  54.84 
 
 
101 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3347  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.02 
 
 
98 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0094  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  52.08 
 
 
96 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1388  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  55.43 
 
 
104 aa  103  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0082  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50 
 
 
97 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.406903  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0080  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50 
 
 
97 aa  103  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0099  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.76 
 
 
101 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0703  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.58 
 
 
101 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3629  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  49.47 
 
 
101 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1825  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  63.01 
 
 
122 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.309531  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0169  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  52.17 
 
 
103 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3922  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50 
 
 
96 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450705  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3226  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.02 
 
 
99 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3550  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.79 
 
 
101 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1468  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  49.45 
 
 
91 aa  100  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2985  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.61 
 
 
130 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3384  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.61 
 
 
130 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1617  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.61 
 
 
130 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4002  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.61 
 
 
101 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4076  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.61 
 
 
130 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0896385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  52.75 
 
 
119 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2926  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.61 
 
 
101 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0207  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.61 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3338  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.61 
 
 
137 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0423  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.55 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0873701  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.32 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3356  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  55.56 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0770  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  54.43 
 
 
95 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.62 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0134  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  59.74 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0057  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.58 
 
 
93 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.80763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3534  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.65 
 
 
125 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4648  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  49.46 
 
 
96 aa  96.7  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0077  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  52.17 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0438  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.04 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01754  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase protein  52.33 
 
 
100 aa  94.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.9371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0010  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.15 
 
 
96 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1118  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0095  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1824  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42 
 
 
101 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.749262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1419  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  47.42 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0254  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  58.44 
 
 
90 aa  93.2  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.569153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5415  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.81 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.236997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1692  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  60.94 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0068  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.91 
 
 
102 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04911  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  42.27 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.449188  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0076  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.91 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2474  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  52.17 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.791787  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0140  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.62 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  47.73 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0077  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.91 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0458718  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2978  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.91 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3258  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.89 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05481  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  39 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.713347  normal  0.538116 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1689  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.01 
 
 
104 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3581  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.48 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2045  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  49.38 
 
 
107 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0827962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.55 
 
 
97 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05551  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.76 
 
 
96 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.593929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.95 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0673  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.57 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252201  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0706  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  45.24 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11183  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  40.66 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  50.65 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0492  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.86 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.032217  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05181  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00643072  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05471  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.375908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2232  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  52.86 
 
 
77 aa  82.4  2e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0376  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40 
 
 
103 aa  80.1  8e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1008  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  51.43 
 
 
76 aa  79.7  1e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14356  predicted protein  60 
 
 
64 aa  79.3  2e-14  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3734  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.3 
 
 
97 aa  79  2e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0006  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  45.12 
 
 
97 aa  78.2  4e-14  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.251541  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0380  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.37 
 
 
96 aa  78.2  4e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.67 
 
 
99 aa  77.4  5e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.75 
 
 
103 aa  77.4  6e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0994809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4024  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  45.45 
 
 
117 aa  77.4  6e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.68 
 
 
97 aa  74.7  4e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.44 
 
 
93 aa  72.8  1e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.76 
 
 
93 aa  72  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0401  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.89 
 
 
112 aa  72.4  2e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.685477  hitchhiker  0.00013147 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0700  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.94 
 
 
96 aa  71.6  3e-12  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000704537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.86 
 
 
94 aa  71.6  3e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4166  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.32 
 
 
117 aa  71.2  5e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.91 
 
 
94 aa  70.9  6e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5000  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.44 
 
 
78 aa  69.7  1e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  7.18198e-05  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4140  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.18 
 
 
117 aa  70.1  1e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.64 
 
 
105 aa  69.3  2e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.29 
 
 
120 aa  67.8  4e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1535  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.78 
 
 
94 aa  67.4  7e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  2.24149e-10  normal  0.214474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.29 
 
 
131 aa  67  8e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1891  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.22 
 
 
116 aa  67  8e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0206929  normal  0.972327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0712  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.78 
 
 
113 aa  66.6  1e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>