More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4108 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_10626  hypothetical protein similar to ATP synthase alpha chain (Broad)  63.69 
 
 
561 aa  683    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.585818  normal  0.812779 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01523  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor (Broad)  67.53 
 
 
556 aa  726    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.96 
 
 
502 aa  690    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.96 
 
 
502 aa  690    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  81.41 
 
 
509 aa  848    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.93 
 
 
503 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  89.39 
 
 
509 aa  922    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2936  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.15 
 
 
512 aa  800    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147396  normal  0.0629902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0220  ATP synthase F1, alpha subunit  80.39 
 
 
509 aa  840    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 
502 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.16 
 
 
512 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.82 
 
 
501 aa  654    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.96 
 
 
509 aa  844    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  89.78 
 
 
509 aa  929    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.93 
 
 
509 aa  846    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.63 
 
 
510 aa  764    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 
502 aa  648    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 
502 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.42 
 
 
501 aa  650    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.65 
 
 
505 aa  646    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.34 
 
 
502 aa  647    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02280  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor, putative  67.13 
 
 
540 aa  700    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.93 
 
 
510 aa  792    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  89.78 
 
 
509 aa  927    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.04 
 
 
505 aa  647    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2203  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.56 
 
 
512 aa  801    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.76 
 
 
509 aa  840    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  90.96 
 
 
509 aa  939    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.33 
 
 
510 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.22 
 
 
505 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.18 
 
 
510 aa  843    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.68 
 
 
502 aa  699    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1315  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.19 
 
 
512 aa  753    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.46 
 
 
526 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.76 
 
 
512 aa  802    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.71 
 
 
502 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.71 
 
 
502 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.27 
 
 
502 aa  702    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.61 
 
 
526 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  82.32 
 
 
510 aa  855    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  59.45 
 
 
541 aa  639    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.46 
 
 
526 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.91 
 
 
503 aa  716    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.1 
 
 
502 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 
502 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.99 
 
 
505 aa  640    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.76 
 
 
509 aa  835    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.95 
 
 
502 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.31 
 
 
502 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  77.25 
 
 
510 aa  800    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  63.58 
 
 
507 aa  651    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.74 
 
 
502 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.33 
 
 
510 aa  678    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  82.35 
 
 
510 aa  851    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.47 
 
 
509 aa  796    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.76 
 
 
509 aa  840    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.91 
 
 
502 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1047  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.56 
 
 
512 aa  803    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.1 
 
 
505 aa  682    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.45 
 
 
505 aa  653    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  80.78 
 
 
510 aa  840    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.51 
 
 
505 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.31 
 
 
502 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.13 
 
 
510 aa  675    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3816  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.93 
 
 
511 aa  795    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905134  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.18 
 
 
510 aa  845    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.06 
 
 
502 aa  709    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.34 
 
 
510 aa  843    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  63.19 
 
 
501 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.58 
 
 
512 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2088  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.8 
 
 
513 aa  797    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509731  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.97 
 
 
509 aa  783    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
508 aa  1019    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.57 
 
 
509 aa  840    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  90.57 
 
 
509 aa  936    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  86.89 
 
 
509 aa  912    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  82.35 
 
 
509 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.74 
 
 
502 aa  652    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 
502 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.72 
 
 
504 aa  652    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47835  synthase of mitochondrial ATP synthase  63.94 
 
 
544 aa  648    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  83.95 
 
 
511 aa  876    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.82 
 
 
501 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86570  F1F0-ATPase complex, F1 alpha subunit  68.99 
 
 
545 aa  727    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0972  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.76 
 
 
512 aa  802    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.74 
 
 
502 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.12 
 
 
510 aa  806    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  80.78 
 
 
510 aa  842    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
501 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3943  F0F1 ATP synthase subunit alpha  90.57 
 
 
509 aa  936    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  81.37 
 
 
509 aa  835    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.47 
 
 
509 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.34 
 
 
502 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.59 
 
 
502 aa  680    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.94 
 
 
505 aa  661    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  67.85 
 
 
507 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>