184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4050 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  100 
 
 
98 aa  199  1e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  81.72 
 
 
94 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  77.42 
 
 
93 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  73.12 
 
 
93 aa  150  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  57.14 
 
 
104 aa  113  8e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  57.14 
 
 
104 aa  113  9e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  59.18 
 
 
104 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  58 
 
 
100 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  57.78 
 
 
89 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  52.75 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  52.22 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  51.09 
 
 
91 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  51.69 
 
 
108 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  54.44 
 
 
91 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  46.88 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  47.42 
 
 
98 aa  82.8  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  47.06 
 
 
124 aa  79.7  1e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  47.78 
 
 
98 aa  77.4  6e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  43.48 
 
 
92 aa  75.5  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  47.13 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  46.51 
 
 
85 aa  74.3  5e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  46.67 
 
 
106 aa  73.9  6e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  46.67 
 
 
93 aa  73.9  7e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  46.51 
 
 
161 aa  73.6  8e-13  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  48.19 
 
 
106 aa  73.2  1e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  44 
 
 
119 aa  72.4  2e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  48.31 
 
 
99 aa  72.4  2e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  44.57 
 
 
92 aa  72.8  2e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  44.57 
 
 
92 aa  72.4  2e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  46.99 
 
 
106 aa  71.6  3e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  50 
 
 
99 aa  72  3e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  49.43 
 
 
90 aa  71.6  3e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  48.75 
 
 
97 aa  70.9  5e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  43.18 
 
 
98 aa  70.5  7e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  51.95 
 
 
97 aa  69.7  1e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  48.78 
 
 
86 aa  69.3  1e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  52.38 
 
 
97 aa  69.7  1e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0082  BolA family protein  47.62 
 
 
92 aa  69.7  1e-11  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  48.24 
 
 
101 aa  67.8  4e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  46.99 
 
 
89 aa  67.8  4e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  48.19 
 
 
102 aa  67.8  5e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  50 
 
 
93 aa  67.4  6e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  44.94 
 
 
99 aa  67.4  6e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  47.56 
 
 
99 aa  67.4  7e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  43.82 
 
 
99 aa  66.6  1e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  45.78 
 
 
85 aa  66.2  1e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  36.67 
 
 
118 aa  65.9  2e-10  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  44.94 
 
 
99 aa  65.1  3e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  42.5 
 
 
104 aa  64.7  4e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  46.99 
 
 
106 aa  64.7  4e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  41.57 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  46.99 
 
 
106 aa  64.3  6e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  46.99 
 
 
106 aa  64.3  6e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  41.57 
 
 
90 aa  63.9  6e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  52.24 
 
 
68 aa  63.9  6e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
104 aa  63.9  7e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  41.46 
 
 
105 aa  62.8  1e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.4736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  41.46 
 
 
105 aa  62.8  1e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.54579e-07  hitchhiker  7.47363e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  44.19 
 
 
105 aa  63.5  1e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
104 aa  62.8  1e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.77187e-06  hitchhiker  2.75713e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  47.5 
 
 
97 aa  62.8  1e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  41.46 
 
 
105 aa  62.8  1e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.66564e-08  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  41.46 
 
 
105 aa  62.8  1e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.13477e-08  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  41.46 
 
 
105 aa  62.8  1e-09  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.55602e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  41.11 
 
 
107 aa  63.5  1e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  41.46 
 
 
105 aa  62.8  1e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.63176e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  41.46 
 
 
105 aa  62.8  1e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  39.08 
 
 
104 aa  63.5  1e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  41.46 
 
 
105 aa  62.8  1e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  3.27919e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  43.37 
 
 
84 aa  63.2  1e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  46.25 
 
 
92 aa  62.8  2e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  41.86 
 
 
85 aa  62.4  2e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  35.64 
 
 
114 aa  62.8  2e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  46.25 
 
 
92 aa  62.8  2e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  41.57 
 
 
99 aa  62.8  2e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  37.93 
 
 
104 aa  61.6  3e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  42.5 
 
 
106 aa  61.2  4e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  41.25 
 
 
104 aa  61.6  4e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.07281e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  44.58 
 
 
99 aa  60.8  6e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  39.02 
 
 
106 aa  60.8  6e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  40.96 
 
 
94 aa  60.5  7e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  40.24 
 
 
105 aa  60.5  8e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  42.68 
 
 
106 aa  60.5  8e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  40.24 
 
 
105 aa  60.5  8e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  40.24 
 
 
105 aa  60.5  8e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.29176e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  40.24 
 
 
105 aa  60.5  8e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  9.73663e-05  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  40.24 
 
 
105 aa  60.5  8e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  3.05516e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  40.24 
 
 
104 aa  60.1  9e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  37.8 
 
 
104 aa  60.5  9e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  43.9 
 
 
105 aa  60.1  9e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  41.18 
 
 
91 aa  60.1  1e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2950  transcriptional regulator BolA  48.75 
 
 
88 aa  60.1  1e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1803  BolA family protein  53.75 
 
 
86 aa  59.7  1e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  37.78 
 
 
102 aa  58.9  2e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 
106 aa  59.3  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.83213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  39.02 
 
 
105 aa  58.9  2e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 
106 aa  59.3  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 
106 aa  59.3  2e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.09706e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  43.37 
 
 
85 aa  58.5  3e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2938  BolA family protein  47.67 
 
 
93 aa  58.5  3e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>