255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4035 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  85.71 
 
 		 258 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  85.66 
 
 		 246 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  81.56 
 
 		 250 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  73.44 
 
 		 259 aa  362  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  70.78 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  67.36 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  72.02 
 
 		 234 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  48.52 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  48.78 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  47.76 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  48.22 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  49.17 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  49 
 
 		 252 aa  235  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  47.76 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  49.58 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  46.5 
 
 		 246 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  45.27 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  49.79 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  48.16 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  48.16 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  48.57 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  48.76 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  48.72 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  49.55 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  48.44 
 
 		 244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  45.19 
 
 		 277 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  39.29 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  39.29 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  39.09 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  42.23 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  37.7 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  38.96 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  39.74 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  38.29 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  33.47 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  30.64 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  30.64 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  30.64 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  30.64 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  30.64 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  30.64 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  30.64 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  30.64 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  31.4 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  29.01 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  28.19 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  30.81 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  27.52 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  27.52 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  26.7 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  42.17 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  28.02 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  35.92 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  34.95 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  46.67 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.59 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  46.81 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  26.51 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  28.37 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 		 511 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  27.92 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  25.95 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  31.63 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  31.65 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  27.41 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>