More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4030 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 
303 aa  627  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.2 
 
 
265 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3575  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.68 
 
 
265 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.614267  normal  0.0350053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2546  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.86 
 
 
259 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  55.21 
 
 
260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.25 
 
 
300 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  55.25 
 
 
260 aa  281  7.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  54.72 
 
 
268 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  49.81 
 
 
268 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.55 
 
 
269 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.89 
 
 
262 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.3 
 
 
269 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.16 
 
 
259 aa  228  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.84 
 
 
255 aa  225  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.31 
 
 
244 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  44.62 
 
 
255 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.75 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.44 
 
 
273 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.84 
 
 
264 aa  208  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.84 
 
 
257 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.7 
 
 
249 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1538  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.15 
 
 
263 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.011975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.02 
 
 
259 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1756  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.99 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.99 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0101999  normal  0.0780436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.99 
 
 
250 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3500  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.34 
 
 
249 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.760694 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0042  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.82 
 
 
240 aa  168  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0735  phospholipid/glycerol acyltransferase  40 
 
 
241 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.985131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2389  phospholipid/glycerol acyltransferase  40 
 
 
241 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.03 
 
 
255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2377  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.36 
 
 
244 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.48 
 
 
236 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3054  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.95 
 
 
251 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0476  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.55 
 
 
241 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  36.52 
 
 
241 aa  155  8e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2453  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.82 
 
 
241 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0904176  normal  0.167894 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3010  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.09 
 
 
228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0072  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  35.59 
 
 
236 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0407  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  34.82 
 
 
264 aa  144  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.650475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.47 
 
 
248 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.05 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.9 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.15 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.12 
 
 
236 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0375  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.92 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  33.05 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1223  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.53 
 
 
248 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  31.58 
 
 
257 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.93 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2015  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.6 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.93 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.35 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.35 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.04 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  33.04 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  33.04 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  33.04 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  33.04 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.04 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.04 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3378  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.67 
 
 
254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.611462  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  32.19 
 
 
259 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3081  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000181964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.97 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.97 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2052  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  33.82 
 
 
249 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.97 
 
 
254 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.1 
 
 
258 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  31.76 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.8 
 
 
253 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.79 
 
 
283 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0957  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.8 
 
 
252 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.79 
 
 
249 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.49 
 
 
252 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.16 
 
 
252 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0530  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.79 
 
 
249 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0626178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.9 
 
 
256 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00250914  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2324  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.17 
 
 
254 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000640297  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0187  hdtS protein  29.25 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.93 
 
 
244 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4200  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.6 
 
 
256 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  30.54 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.68 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2597  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.51 
 
 
264 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504702  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.48 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4741  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.65 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0357  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.08 
 
 
249 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0011  Protoheme IX farnesyltransferase  30.29 
 
 
240 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.48 
 
 
240 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.52 
 
 
246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.78 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4174  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.19 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  0.278578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.69 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.78 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000544756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.46 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0058  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.09 
 
 
261 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000912039  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.09 
 
 
261 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.3 
 
 
244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.983241  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3069  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.63 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.0056603  hitchhiker  0.00898563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>