More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4017 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  89.08 
 
 		 467 aa  865    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  89.87 
 
 		 466 aa  866    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  80 
 
 		 466 aa  770    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  71.59 
 
 		 466 aa  684    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  67.03 
 
 		 471 aa  636    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  67.62 
 
 		 460 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 467 aa  956    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  68.13 
 
 		 463 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  89.72 
 
 		 467 aa  867    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  80.48 
 
 		 473 aa  760    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  80 
 
 		 493 aa  771    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  80.22 
 
 		 466 aa  771    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  70.22 
 
 		 469 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  67.03 
 
 		 471 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  66.59 
 
 		 471 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  66.23 
 
 		 463 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 		 463 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  66.23 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  65.78 
 
 		 459 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  68.34 
 
 		 463 aa  621  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  66.38 
 
 		 476 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  65.73 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  65.79 
 
 		 465 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  65.41 
 
 		 455 aa  604  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  65.79 
 
 		 465 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  65.35 
 
 		 465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  65.56 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 		 462 aa  601  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  64.47 
 
 		 488 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  66.81 
 
 		 466 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  64.88 
 
 		 478 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  64.47 
 
 		 465 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  64.25 
 
 		 463 aa  591  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  64.04 
 
 		 465 aa  589  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  62.47 
 
 		 471 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  62.69 
 
 		 469 aa  576  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  65.78 
 
 		 462 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  60.63 
 
 		 458 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  57.57 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  56.44 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  56.48 
 
 		 470 aa  534  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  61.56 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 458 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  56.26 
 
 		 458 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  55.21 
 
 		 458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  55.13 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  54.57 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  55.58 
 
 		 469 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  55.38 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  54.34 
 
 		 458 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  55.31 
 
 		 458 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  55.41 
 
 		 464 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  56.21 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  54.97 
 
 		 464 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  54 
 
 		 461 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  50.84 
 
 		 491 aa  497  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  54.08 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  53.9 
 
 		 475 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  54.59 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  53.86 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  54.12 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  54.08 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  53.86 
 
 		 499 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  54.15 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  54.69 
 
 		 478 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  52.72 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  53.29 
 
 		 489 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  53.61 
 
 		 464 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  52.34 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  53.93 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  53.61 
 
 		 464 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  53.36 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  51.99 
 
 		 462 aa  482  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  51.89 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  52.55 
 
 		 460 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  54.26 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  53.9 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  53.73 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  51.45 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  54.89 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  53.35 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 		 468 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  53.69 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  53.12 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  52.72 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  52.63 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  52.63 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 		 490 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  53.24 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>