76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3983 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  100 
 
 		 467 aa  920    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  62.9 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  62.47 
 
 		 471 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  62.85 
 
 		 474 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  47.31 
 
 		 490 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  44 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  36.24 
 
 		 460 aa  263  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  35.21 
 
 		 458 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  37.25 
 
 		 455 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  34.99 
 
 		 456 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  36.24 
 
 		 453 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  36.48 
 
 		 459 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  35.55 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  35.92 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  37.7 
 
 		 446 aa  203  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  36.49 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  34.98 
 
 		 458 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  35.88 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  37.74 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  38.99 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 		 539 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  31.52 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.86 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  34.04 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  31.25 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  21.76 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  23.97 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  36.22 
 
 		 582 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 		 504 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0449  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.757285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.94 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  26.37 
 
 		 522 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  31.41 
 
 		 536 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.19 
 
 		 495 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 458 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  25.54 
 
 		 450 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  26.78 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  25.27 
 
 		 523 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0796  hypothetical membrane associated protein  23.2 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.610272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  20.93 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  33.02 
 
 		 135 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  26.11 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.89 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 529 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  45.33 
 
 		 456 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>