86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3848 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  677    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  60.86 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  48.2 
 
 		 342 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  48.2 
 
 		 339 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  42.01 
 
 		 328 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  36.9 
 
 		 373 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  38.24 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  32.84 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  34.01 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  32.63 
 
 		 374 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  34.4 
 
 		 343 aa  125  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  29.86 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  28.01 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  27.66 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  30.3 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  28.02 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.3 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  28.62 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  29.1 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  27.59 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  28.38 
 
 		 543 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  27.59 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  28.25 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  28.3 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  27.08 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  27.48 
 
 		 565 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.87 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  28.69 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  31.56 
 
 		 607 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  23.8 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  28.45 
 
 		 601 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.24 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.87 
 
 		 547 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  26.3 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  27.6 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.06 
 
 		 571 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  25.88 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  25.88 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  26.32 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  28.33 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.84 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  25.19 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  21.31 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  24.58 
 
 		 546 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.97 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  22.91 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  25.82 
 
 		 568 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  26.75 
 
 		 542 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  25.56 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.54 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  23.51 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.57 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  26.19 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  24.5 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  25.1 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  24.5 
 
 		 600 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  29.2 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.57 
 
 		 545 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  25.87 
 
 		 551 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  24.82 
 
 		 533 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.87 
 
 		 569 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  24.69 
 
 		 572 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  25.58 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  25.48 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  25.09 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  21.94 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  30.85 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  28.98 
 
 		 526 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  23.67 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  23.93 
 
 		 567 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  25.75 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  24.59 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  24.89 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.62 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.24 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.9 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  27.34 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  22.48 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  24.25 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  23.64 
 
 		 476 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  29.17 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  24.59 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  30.56 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.4 
 
 		 361 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  29.17 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>