45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3841 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  100 
 
 		 235 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  72.69 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  73.78 
 
 		 237 aa  295  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  61.14 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  69.87 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  60.09 
 
 		 242 aa  257  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  61.43 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  61.43 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  51.56 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  44.73 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  42.15 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  44.39 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  41.7 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  43.64 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  40.08 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  39.58 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  40.17 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  41.2 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  39.33 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  43.75 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  37.6 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  39.75 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  47.88 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  41.59 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  45.19 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  43.15 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  40.54 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  40.54 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  36.28 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  41.36 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  37.58 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  35.54 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  35.5 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  34.67 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  29.1 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  28.66 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  22.67 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  23.98 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  23.98 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  23.98 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  23.98 
 
 		 253 aa  42  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  23.98 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  23.98 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  23.98 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  23.98 
 
 		 253 aa  42  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>