More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3836 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.09 
 
 		 528 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  63.05 
 
 		 525 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  70.34 
 
 		 529 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  70.34 
 
 		 529 aa  736    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  100 
 
 		 525 aa  1065    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.93 
 
 		 529 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.48 
 
 		 529 aa  748    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  63.23 
 
 		 522 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.48 
 
 		 525 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  70.67 
 
 		 532 aa  747    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.81 
 
 		 525 aa  651    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  70.49 
 
 		 532 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  63.48 
 
 		 525 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  69.41 
 
 		 525 aa  743    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.16 
 
 		 532 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.34 
 
 		 528 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.42 
 
 		 530 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.45 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  56.73 
 
 		 529 aa  591  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.94 
 
 		 531 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.45 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.43 
 
 		 526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.64 
 
 		 517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.08 
 
 		 523 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.39 
 
 		 536 aa  445  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.27 
 
 		 523 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.57 
 
 		 516 aa  438  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.51 
 
 		 530 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  45.63 
 
 		 508 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.97 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.26 
 
 		 532 aa  422  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.29 
 
 		 543 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.77 
 
 		 524 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.72 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.41 
 
 		 524 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.88 
 
 		 524 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.72 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.83 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.4 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.91 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.79 
 
 		 512 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.74 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.75 
 
 		 510 aa  339  9e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 516 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 		 526 aa  326  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  39.26 
 
 		 529 aa  324  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.65 
 
 		 538 aa  323  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 516 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 		 535 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 516 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  36.45 
 
 		 519 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 		 539 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.01 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  41.65 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.57 
 
 		 526 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 542 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.74 
 
 		 543 aa  317  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 		 542 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 542 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 542 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 		 517 aa  316  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.6 
 
 		 536 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.53 
 
 		 516 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  41.2 
 
 		 539 aa  313  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.9 
 
 		 539 aa  312  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.2 
 
 		 540 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  35.91 
 
 		 499 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 		 519 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  34.65 
 
 		 534 aa  302  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.19 
 
 		 517 aa  289  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 529 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.53 
 
 		 532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 		 524 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 523 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 		 517 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.72 
 
 		 526 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 516 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 515 aa  280  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  32.18 
 
 		 528 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.58 
 
 		 527 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 515 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.66 
 
 		 532 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 524 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.24 
 
 		 528 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 539 aa  272  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.93 
 
 		 539 aa  272  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 		 537 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 523 aa  270  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.78 
 
 		 515 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 		 511 aa  267  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 		 527 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
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NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 504 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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